More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17346 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  100 
 
 
358 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  49.69 
 
 
658 aa  325  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  49.04 
 
 
343 aa  312  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  49.52 
 
 
323 aa  312  5.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  47.87 
 
 
365 aa  289  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  43.98 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  46.67 
 
 
350 aa  275  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  38.7 
 
 
332 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  39.04 
 
 
358 aa  230  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  40.76 
 
 
330 aa  230  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  39.43 
 
 
330 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  39.49 
 
 
333 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  38.61 
 
 
407 aa  219  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  37 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  38.29 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  38.26 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  38.31 
 
 
358 aa  212  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  38.12 
 
 
325 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  36.08 
 
 
325 aa  210  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  36.76 
 
 
327 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  37.97 
 
 
388 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  33.33 
 
 
329 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  37.08 
 
 
324 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  36.5 
 
 
324 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  37.69 
 
 
322 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  36.84 
 
 
322 aa  192  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  34.38 
 
 
349 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  33.43 
 
 
343 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  33.82 
 
 
343 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  32.36 
 
 
348 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  39.1 
 
 
322 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  37.97 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  32.63 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  37.97 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  38.35 
 
 
322 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  34.39 
 
 
315 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  29.25 
 
 
314 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  32.77 
 
 
250 aa  106  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.62 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.9 
 
 
307 aa  102  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  29.07 
 
 
311 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  30.43 
 
 
358 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  32.51 
 
 
227 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  33.05 
 
 
221 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  30.93 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  30.86 
 
 
235 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  28.51 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  29.71 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  30.63 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  32.39 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  29.24 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  27.38 
 
 
243 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  26.48 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  27.65 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  28.11 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  28.45 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  26.64 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  28.4 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  28.74 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  27.31 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  26.2 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  30.58 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  26.98 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.52 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  26.91 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  26.72 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  27.24 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  26.74 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  27.94 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  28.51 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  28.28 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  27.94 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  27.42 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  29.68 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  28.62 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  28.74 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  24.62 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  27.73 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  27.53 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  24.74 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  22.29 
 
 
541 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  28.29 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  28.08 
 
 
213 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5195  recA protein  27.93 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  28.85 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  25.95 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  28.52 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  25.95 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  31.75 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  26.57 
 
 
336 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  30.89 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  27.49 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  29.84 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  27.43 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  28.17 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3351  recA protein  27.48 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  28.17 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4001  recA protein  27.48 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.627229  normal  0.688491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  29.55 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>