116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15879 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  100 
 
 
515 aa  1036    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  36.14 
 
 
351 aa  158  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  31.16 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  28.85 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  41.46 
 
 
404 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  40.65 
 
 
404 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  40.65 
 
 
404 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  35.75 
 
 
414 aa  90.9  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  40.16 
 
 
496 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  43.69 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  41.9 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  40 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  36.57 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  36.29 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  29.06 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  32.48 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  34.52 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  37.61 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  30.39 
 
 
298 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  35.34 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  33.66 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  27.13 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  30.47 
 
 
400 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  29.73 
 
 
395 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  27.14 
 
 
303 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  34.09 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  32.11 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  27.63 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  30.82 
 
 
388 aa  57.4  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  36.78 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  40 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  37.23 
 
 
386 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  40.74 
 
 
374 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  26.72 
 
 
395 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  34.69 
 
 
376 aa  53.9  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  36.78 
 
 
378 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  25.53 
 
 
376 aa  50.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  26.79 
 
 
626 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  34.83 
 
 
379 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  34.83 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  34.83 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  34.83 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  50.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  36.78 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  33.71 
 
 
376 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  34.83 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  35.37 
 
 
380 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.93 
 
 
301 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  34.48 
 
 
372 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.62 
 
 
281 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  34.57 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  27.78 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  27.78 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  27.78 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  32.56 
 
 
402 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  34.15 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  31.76 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  32.99 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  31.4 
 
 
375 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  32.95 
 
 
406 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  32.95 
 
 
406 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  35.37 
 
 
379 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  27.78 
 
 
373 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  35.37 
 
 
379 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33394  predicted protein  29.57 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.551934  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  27.78 
 
 
373 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  32.56 
 
 
368 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  35.37 
 
 
379 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  26.98 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  31.11 
 
 
392 aa  47  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  31.11 
 
 
392 aa  47  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  36.36 
 
 
407 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  35.96 
 
 
409 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0989  Cupin 4 family protein  34.78 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0764478  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  31.82 
 
 
406 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  35.96 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  37.68 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  31.63 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  31.18 
 
 
373 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  38.03 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  36.23 
 
 
384 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  34.25 
 
 
373 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  32.56 
 
 
370 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 
406 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  28.7 
 
 
235 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>