26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15759 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_15759  predicted protein  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 702 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  35.58 
 
 		 1241 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  30.91 
 
 		 1189 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.11 
 
 		 706 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  33.68 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.69 
 
 		 712 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.67 
 
 		 712 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  34.41 
 
 		 339 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3446  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.04 
 
 		 714 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0543  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 771 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.109089  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2482  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.63 
 
 		 772 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.676792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  42.53 
 
 		 756 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  36.78 
 
 		 718 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  30.36 
 
 		 492 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.91 
 
 		 774 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3785  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.48 
 
 		 708 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.668029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  32.32 
 
 		 487 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  30.36 
 
 		 496 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  32.65 
 
 		 481 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.7 
 
 		 701 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  30.36 
 
 		 488 aa  42.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  30.91 
 
 		 485 aa  42.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 		 720 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  30.1 
 
 		 328 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  31.07 
 
 		 321 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>