More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15642 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  100 
 
 
1432 aa  2954    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  32.74 
 
 
1843 aa  208  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  31.44 
 
 
1415 aa  136  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  30.94 
 
 
1586 aa  120  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  28.87 
 
 
1202 aa  109  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  26.46 
 
 
1761 aa  109  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.51 
 
 
1184 aa  104  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  23.65 
 
 
701 aa  101  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  29.25 
 
 
1132 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  29.33 
 
 
900 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  38.16 
 
 
985 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  25 
 
 
1198 aa  97.8  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  24.78 
 
 
715 aa  95.5  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  29.84 
 
 
1277 aa  95.1  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  22.61 
 
 
1359 aa  92.8  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  25.09 
 
 
1127 aa  92.4  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
1160 aa  90.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  34.38 
 
 
1164 aa  90.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  34.64 
 
 
1170 aa  89.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  25.39 
 
 
1161 aa  89  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  34.38 
 
 
1154 aa  89  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 
842 aa  88.2  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82348  DNA-dependent ATPase of the nucleotide excision repair factor 4 complex  22.48 
 
 
1343 aa  87.8  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.968646  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
1171 aa  88.2  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.57 
 
 
1110 aa  87.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  31.4 
 
 
1112 aa  87  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
1261 aa  86.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
982 aa  86.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  25.93 
 
 
972 aa  86.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.69 
 
 
1102 aa  85.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  25.36 
 
 
849 aa  83.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  38.03 
 
 
832 aa  83.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  21.43 
 
 
707 aa  82.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  32.39 
 
 
1120 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  23.67 
 
 
1531 aa  82.4  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
1091 aa  82.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  40.87 
 
 
1141 aa  82.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  27.43 
 
 
1086 aa  82.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  35.51 
 
 
1362 aa  82  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  33.09 
 
 
1127 aa  82  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  32.39 
 
 
1120 aa  81.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  27.43 
 
 
806 aa  81.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  34.21 
 
 
964 aa  81.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  39.82 
 
 
1078 aa  81.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  29.56 
 
 
1142 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  23.86 
 
 
1250 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  35.51 
 
 
1386 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  28.86 
 
 
1093 aa  80.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  33.54 
 
 
1045 aa  80.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  23.63 
 
 
1023 aa  80.9  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  33.09 
 
 
746 aa  80.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  22.99 
 
 
1072 aa  79.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
1021 aa  79.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.94 
 
 
1047 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  22.94 
 
 
1047 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30.25 
 
 
1130 aa  79.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  34.73 
 
 
1354 aa  79.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.83 
 
 
1181 aa  79  0.0000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  37.69 
 
 
1284 aa  79  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
1164 aa  79  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.03 
 
 
1082 aa  78.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  36 
 
 
1159 aa  78.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
1069 aa  78.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  24.01 
 
 
1125 aa  78.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  29.03 
 
 
1013 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  30.3 
 
 
1107 aa  77.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
1066 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  23.37 
 
 
1068 aa  77.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  35.06 
 
 
1163 aa  77.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
1068 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
1129 aa  76.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.54 
 
 
977 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  28.66 
 
 
1003 aa  76.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
1152 aa  76.6  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  33.59 
 
 
1080 aa  76.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  24.13 
 
 
918 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  23.05 
 
 
860 aa  76.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.06 
 
 
914 aa  76.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  34.4 
 
 
1063 aa  75.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 
1069 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.3 
 
 
1134 aa  75.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  29.28 
 
 
1904 aa  75.1  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  33.53 
 
 
663 aa  75.1  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
1068 aa  75.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  33.77 
 
 
1357 aa  75.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 
1074 aa  74.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  31.21 
 
 
1073 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  27.75 
 
 
1901 aa  74.7  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  34.96 
 
 
898 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.2 
 
 
1048 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  26.25 
 
 
1100 aa  74.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32 
 
 
1769 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.92 
 
 
1143 aa  74.3  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
1055 aa  75.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.21 
 
 
1099 aa  73.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01961  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10830)  40.7 
 
 
1502 aa  74.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.288064  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 
1050 aa  73.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  25.8 
 
 
988 aa  73.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 
950 aa  73.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.19 
 
 
1091 aa  73.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>