More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12187 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  100 
 
 		 176 aa  353  5.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 182 aa  203  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 182 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 187 aa  197  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  49.14 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  49.13 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  48 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  52 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  52.57 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 182 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 185 aa  180  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  48 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  48 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  48.26 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 187 aa  173  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  44 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  170  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  41.71 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>