More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119580 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119580  predicted protein  100 
 
 
525 aa  1079    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00236859  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03050  signal recognition particle binding protein, putative  45.54 
 
 
674 aa  273  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14212  predicted protein  42.91 
 
 
308 aa  235  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0513448  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06627  signal sequence receptor alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03850)  40.47 
 
 
636 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.771052  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.72 
 
 
513 aa  212  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87761  GTP binding signal recognition particle receptor  37.11 
 
 
545 aa  201  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.91 
 
 
373 aa  187  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.6 
 
 
358 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.72 
 
 
307 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.74 
 
 
400 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.93 
 
 
383 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.1 
 
 
344 aa  181  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.12 
 
 
379 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.12 
 
 
383 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.74 
 
 
353 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.92 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.02 
 
 
379 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.53 
 
 
337 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.46 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.16 
 
 
383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.88 
 
 
302 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.33 
 
 
371 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.16 
 
 
354 aa  171  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.86 
 
 
305 aa  170  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.45 
 
 
302 aa  170  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.65 
 
 
305 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.11 
 
 
529 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.33 
 
 
367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.64 
 
 
409 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.91 
 
 
307 aa  162  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.44 
 
 
394 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.02 
 
 
305 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.3 
 
 
470 aa  159  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0809  signal recognition particle protein  33.92 
 
 
445 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0556  signal recognition particle protein  32.17 
 
 
444 aa  137  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.521586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1297  signal recognition particle protein  35.85 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0732  signal recognition particle protein  33.92 
 
 
445 aa  135  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124171  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  27.94 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  30.17 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0390  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.44 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.42 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  37.98 
 
 
444 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0997  signal recognition particle protein  32.52 
 
 
445 aa  130  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1680  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.87 
 
 
444 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.990278  normal  0.232979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  31.77 
 
 
516 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.33 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.88 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  28.76 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.29 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  36.14 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.14 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  36.14 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  32.17 
 
 
499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  36.14 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1371  signal recognition particle-docking protein FtsY  32 
 
 
306 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414479  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  36.14 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  36.14 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  28.19 
 
 
488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  36.14 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  30.72 
 
 
517 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.85 
 
 
329 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  29.89 
 
 
453 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  28.33 
 
 
444 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05700  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.43 
 
 
384 aa  128  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00177704  normal  0.0500251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.01 
 
 
497 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  35.74 
 
 
497 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.66 
 
 
494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0727  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.71 
 
 
536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1039  signal recognition particle protein  31.82 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00689452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  29.9 
 
 
505 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  28.23 
 
 
512 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  29.9 
 
 
513 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.43 
 
 
473 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.38 
 
 
295 aa  127  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl479  signal recognition particle (signal binding protein)  27.3 
 
 
450 aa  126  7e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.87256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.32 
 
 
328 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.83 
 
 
483 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  29.59 
 
 
446 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  30.1 
 
 
508 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  28.04 
 
 
492 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  33.33 
 
 
471 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.69 
 
 
514 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.43 
 
 
437 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  28.29 
 
 
449 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  28.04 
 
 
492 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.17 
 
 
452 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  29.35 
 
 
449 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1221  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.91 
 
 
288 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1340  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.91 
 
 
288 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.903625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.91 
 
 
329 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  34.91 
 
 
329 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  29.35 
 
 
449 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.91 
 
 
329 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  27.89 
 
 
446 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.91 
 
 
329 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.33 
 
 
535 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  35.74 
 
 
497 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0201  signal recognition particle protein  28 
 
 
460 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.75 
 
 
329 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.39 
 
 
483 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>