More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119543 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  100 
 
 		 532 aa  1101    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.3 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.16 
 
 		 498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.29 
 
 		 514 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  39.47 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  36.36 
 
 		 603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  35.4 
 
 		 546 aa  293  5e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  34.45 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  37.95 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  38.86 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  37.05 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  40.36 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  37.66 
 
 		 468 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  40.36 
 
 		 473 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  40.36 
 
 		 473 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  37.15 
 
 		 498 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  37.03 
 
 		 485 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  38.78 
 
 		 473 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.82 
 
 		 472 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.43 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.68 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.08 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.16 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.64 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.17 
 
 		 474 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.07 
 
 		 411 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  34.31 
 
 		 483 aa  220  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.72 
 
 		 500 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  31.93 
 
 		 605 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  31.45 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.05 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  37.17 
 
 		 494 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.66 
 
 		 516 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.02 
 
 		 425 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1646  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.89 
 
 		 531 aa  161  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360042  hitchhiker  0.00112571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  29.2 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  30.64 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  30.29 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  30.29 
 
 		 384 aa  136  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  29.43 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  29.01 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.13 
 
 		 403 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.39 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  27.35 
 
 		 390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  29.64 
 
 		 384 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  27.89 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.72 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  28.4 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  28.47 
 
 		 363 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  27.59 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  32.32 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.82 
 
 		 365 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  25.16 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  27.78 
 
 		 365 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  28.26 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3826  glutamate decarboxylase  22.36 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  22.8 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1640  glutamate decarboxylase  25.72 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0551  glutamate decarboxylase  21.39 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  23.19 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2691  glutamate decarboxylase  25.45 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0236488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  24.13 
 
 		 457 aa  87.8  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  22.58 
 
 		 464 aa  87.4  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03063  glutamate decarboxylase  24.04 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4739  glutamate decarboxylase  22.62 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4935  glutamate decarboxylase  24.12 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  22.82 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40180  Glutamate decarboxylase (GAD) (ERT D1)  25.19 
 
 		 569 aa  80.1  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  23.88 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0149  glutamate decarboxylase  20.45 
 
 		 496 aa  80.1  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.283505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  23.88 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  23.88 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1483  glutamate decarboxylase  24.15 
 
 		 463 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66379  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  23.15 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.59 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  26.14 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  24.71 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  22.62 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  22.54 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  26.35 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  24.05 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3820  glutamate decarboxylase GadB  22.87 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01451  glutamate decarboxylase B, PLP-dependent  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03365  glutamate decarboxylase A, PLP-dependent  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0196  glutamate decarboxylase  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2153  glutamate decarboxylase  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3720  glutamate decarboxylase GadA  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0200  glutamate decarboxylase  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.718769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1682  glutamate decarboxylase GadB  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.99 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01464  hypothetical protein  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03318  hypothetical protein  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2164  glutamate decarboxylase  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.19141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1680  glutamate decarboxylase GadA  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4005  glutamate decarboxylase  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2106  glutamate decarboxylase GadA  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  26.35 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.79 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8660  glutamate decarboxylase  22.56 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1756  glutamate decarboxylase GadB  22.87 
 
 		 466 aa  73.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.347541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>