255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_1178 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  100 
 
 
609 aa  1231    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  41.53 
 
 
622 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  42.66 
 
 
686 aa  340  4e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  35.78 
 
 
754 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  40.8 
 
 
622 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  41.53 
 
 
619 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  34.05 
 
 
748 aa  334  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  36.11 
 
 
611 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  40.26 
 
 
651 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  34.42 
 
 
716 aa  306  7e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  36.6 
 
 
650 aa  301  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  36.14 
 
 
650 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  36.25 
 
 
636 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  36.05 
 
 
632 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  35.87 
 
 
635 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  35.51 
 
 
636 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.47 
 
 
655 aa  277  4e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  32.21 
 
 
633 aa  270  8e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  32.37 
 
 
633 aa  267  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  31.44 
 
 
633 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  32.3 
 
 
643 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.95 
 
 
633 aa  246  9e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  38.82 
 
 
464 aa  246  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  32.98 
 
 
466 aa  220  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  33.33 
 
 
479 aa  203  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  33.77 
 
 
1077 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  30.65 
 
 
952 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  33.26 
 
 
1090 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.03 
 
 
797 aa  196  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  31.92 
 
 
2245 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  33.06 
 
 
1999 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  44.03 
 
 
237 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.82 
 
 
1048 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  36.65 
 
 
388 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.11 
 
 
1097 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.07 
 
 
902 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  39.64 
 
 
268 aa  153  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  31.9 
 
 
934 aa  153  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  32.32 
 
 
629 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.27 
 
 
553 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.27 
 
 
553 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.6 
 
 
902 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  39.21 
 
 
752 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  36.45 
 
 
1189 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.41 
 
 
986 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.92 
 
 
585 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.65 
 
 
795 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.61 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.64 
 
 
715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  36.69 
 
 
901 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  30.69 
 
 
1038 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  31.27 
 
 
1653 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  28.02 
 
 
759 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.8 
 
 
759 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.8 
 
 
759 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.8 
 
 
759 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.84 
 
 
941 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  28.21 
 
 
759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  28.21 
 
 
759 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.5 
 
 
1099 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  28.21 
 
 
769 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  27.99 
 
 
759 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  27.78 
 
 
759 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.17 
 
 
769 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  31.62 
 
 
315 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  27.62 
 
 
759 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.1 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  31.35 
 
 
1585 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  31.35 
 
 
1585 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  31.91 
 
 
1620 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  32.65 
 
 
283 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  31.27 
 
 
1018 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.14 
 
 
606 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  28.93 
 
 
1111 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  26.97 
 
 
1284 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
2310 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.77 
 
 
297 aa  92  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 
1041 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.92 
 
 
1116 aa  90.5  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  24.38 
 
 
1175 aa  88.2  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.96 
 
 
1428 aa  87.4  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  29.01 
 
 
1143 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.39 
 
 
922 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  29.55 
 
 
1143 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.36 
 
 
916 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  29.55 
 
 
1143 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  28.47 
 
 
1126 aa  84  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.78 
 
 
659 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  29.17 
 
 
1651 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  28.62 
 
 
1228 aa  82.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.88 
 
 
1250 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  25.23 
 
 
1190 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  25 
 
 
1002 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  30.19 
 
 
1082 aa  81.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.38 
 
 
1324 aa  81.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.41 
 
 
1172 aa  81.3  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  32.32 
 
 
1196 aa  81.3  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.76 
 
 
1153 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  29.89 
 
 
1118 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  30.24 
 
 
1408 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>