More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_1075 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_1075  predicted protein  100 
 
 
518 aa  1054  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  37.73 
 
 
582 aa  320  5e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  35.81 
 
 
732 aa  303  4e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  34.85 
 
 
645 aa  303  5e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  35.8 
 
 
521 aa  302  8e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  37.25 
 
 
533 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  36.14 
 
 
623 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  34.94 
 
 
557 aa  292  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  35.11 
 
 
751 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  36.04 
 
 
752 aa  289  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.46 
 
 
625 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  34.9 
 
 
527 aa  286  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  35.55 
 
 
609 aa  285  2e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  34.48 
 
 
631 aa  283  7e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  33.27 
 
 
610 aa  273  4e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  33.65 
 
 
642 aa  262  9e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  32.82 
 
 
627 aa  261  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.55 
 
 
640 aa  260  5e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  33.97 
 
 
618 aa  259  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.55 
 
 
640 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  35.11 
 
 
625 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.55 
 
 
640 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  34.1 
 
 
625 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  33.27 
 
 
625 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  33.27 
 
 
615 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  33.27 
 
 
615 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  34.23 
 
 
625 aa  256  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  34.16 
 
 
645 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  34.1 
 
 
625 aa  256  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  33.72 
 
 
615 aa  255  1e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  32.69 
 
 
633 aa  254  2e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  34.4 
 
 
654 aa  255  2e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  31.74 
 
 
685 aa  254  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
640 aa  254  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
627 aa  253  5e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 
635 aa  253  8e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  33.53 
 
 
627 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 
637 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  32.38 
 
 
634 aa  250  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  34.17 
 
 
615 aa  249  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  35.84 
 
 
619 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  35.7 
 
 
625 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  32.89 
 
 
637 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
624 aa  249  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.13 
 
 
635 aa  249  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  34.35 
 
 
625 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  31.93 
 
 
629 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.01 
 
 
635 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  30.94 
 
 
627 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  8.40512e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.01 
 
 
635 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.01 
 
 
635 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.06 
 
 
635 aa  246  5e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  33.97 
 
 
622 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.63 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  31.63 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
637 aa  246  1e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  31.63 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38837e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
635 aa  246  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  32.71 
 
 
651 aa  246  1e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2537  ABC transporter related  33.59 
 
 
627 aa  246  1e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265447  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
637 aa  245  1e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 
634 aa  245  1e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  31.26 
 
 
638 aa  245  1e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
637 aa  245  2e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  33.52 
 
 
672 aa  244  2e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  31.49 
 
 
627 aa  244  2e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  2.89587e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.87 
 
 
639 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 
637 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  32.51 
 
 
673 aa  244  4e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  31.83 
 
 
637 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  31.83 
 
 
637 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 
637 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  31.17 
 
 
631 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  31.83 
 
 
637 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  34.29 
 
 
626 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3856  ABC transporter related  32.71 
 
 
559 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 
639 aa  239  6e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  34.46 
 
 
645 aa  239  7e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  34.42 
 
 
627 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  32.38 
 
 
659 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  32.89 
 
 
524 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  33.27 
 
 
642 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  34.21 
 
 
621 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  32.58 
 
 
657 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 
676 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  34.29 
 
 
623 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  30.94 
 
 
636 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  31.12 
 
 
637 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  31.12 
 
 
637 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  31.12 
 
 
637 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  32.13 
 
 
527 aa  237  5e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  32.69 
 
 
643 aa  236  5e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  34.46 
 
 
692 aa  237  5e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
635 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  31.9 
 
 
636 aa  236  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  34.87 
 
 
623 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  33.97 
 
 
620 aa  235  1e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>