63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10530 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_10530  predicted protein  100 
 
 
103 aa  213  1e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_13471  RNA-binding protein  47.96 
 
 
165 aa  101  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0775963 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13402  predicted protein  46.15 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  49.51 
 
 
353 aa  99  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01030  conserved hypothetical protein  44.12 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.584283  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  42.67 
 
 
434 aa  72  3e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  44.44 
 
 
477 aa  69.7  1e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  42.27 
 
 
393 aa  69.7  1e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  40.26 
 
 
453 aa  62  3e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  33.66 
 
 
446 aa  61.2  5e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
125 aa  55.1  3e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  32.26 
 
 
328 aa  52.4  2e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  33.8 
 
 
605 aa  49.3  2e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  34.57 
 
 
690 aa  49.3  2e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  35.06 
 
 
245 aa  47.4  6e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
104 aa  47  8e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.84 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  1.35251e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  29.49 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  28.21 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30.49 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  9.87848e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  36.49 
 
 
499 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  29.63 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  30.86 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  4.24033e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  28.05 
 
 
176 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  27.63 
 
 
90 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  27.16 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  7.18119e-07  unclonable  8.80793e-06 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  32.79 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  32.39 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  30.12 
 
 
524 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  30.26 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.39 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  33.8 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  30.99 
 
 
673 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
137 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.58 
 
 
143 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  28.28 
 
 
129 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  5.22116e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  3.46845e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  27.5 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  1.89829e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  26.51 
 
 
455 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  26.83 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
444 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  26.67 
 
 
552 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  27.55 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  9.73374e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  42.55 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  35.94 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  25 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  29.41 
 
 
223 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  28.38 
 
 
687 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>