More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10503 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  100 
 
 
170 aa  346  9e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  43.37 
 
 
181 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  42.14 
 
 
190 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  40.48 
 
 
184 aa  128  4e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.31404e-15 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  39.76 
 
 
184 aa  125  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  40.49 
 
 
187 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  42.59 
 
 
277 aa  123  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  39.88 
 
 
187 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  40 
 
 
169 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  39.38 
 
 
181 aa  117  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  39.75 
 
 
191 aa  116  1e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  37.04 
 
 
185 aa  110  8e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  38.46 
 
 
185 aa  110  8e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  35.37 
 
 
198 aa  110  1e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  38.27 
 
 
197 aa  110  1e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  37.27 
 
 
199 aa  110  1e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  37.34 
 
 
185 aa  109  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  35.37 
 
 
198 aa  109  2e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  36.71 
 
 
185 aa  108  4e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  35.88 
 
 
192 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  37.09 
 
 
173 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  37.01 
 
 
172 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  38.12 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  37.18 
 
 
197 aa  98.2  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  38.22 
 
 
167 aa  97.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  1.3813e-08  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  36.94 
 
 
170 aa  97.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  40.88 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  40.12 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  37.5 
 
 
193 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  37.5 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  36.94 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  36.48 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  35.1 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  39.1 
 
 
199 aa  95.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  39.39 
 
 
264 aa  94.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  37.27 
 
 
178 aa  94  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  38.22 
 
 
169 aa  94  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  38.85 
 
 
199 aa  94  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  37.97 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  36.97 
 
 
195 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  37.58 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  36.02 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  36.13 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  37.58 
 
 
168 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  33.76 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  37.18 
 
 
202 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  36.31 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  35.67 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  34.81 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  34.18 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  34.81 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  34.81 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  34.81 
 
 
165 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  34.78 
 
 
192 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  36.25 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  34.81 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1776  shikimate kinase II  38.71 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.769228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  37.82 
 
 
190 aa  87.8  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  34.78 
 
 
197 aa  87.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  35.44 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  35.44 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  34.81 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  35.03 
 
 
186 aa  87  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 
579 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  34.16 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  35.4 
 
 
196 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  34.18 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  33.33 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  38.85 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  35.4 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  35.44 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  38.31 
 
 
220 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  34.87 
 
 
174 aa  83.6  1e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  37.27 
 
 
171 aa  83.6  1e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  33.94 
 
 
190 aa  83.6  1e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 
593 aa  84  1e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  30.77 
 
 
181 aa  82.4  2e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  45.45 
 
 
177 aa  82.4  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  34.87 
 
 
174 aa  83.2  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  33.78 
 
 
174 aa  83.2  2e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  32.72 
 
 
170 aa  82.8  2e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  34.87 
 
 
174 aa  83.2  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.84 
 
 
539 aa  83.2  2e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  36.24 
 
 
206 aa  82.4  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  35.1 
 
 
156 aa  82.4  3e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3113  shikimate kinase II  35.29 
 
 
173 aa  82  4e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  38.93 
 
 
176 aa  82  4e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.4 
 
 
604 aa  82  4e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.4 
 
 
579 aa  82  4e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  33.33 
 
 
208 aa  81.3  5e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  36.84 
 
 
172 aa  81.3  7e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  33.54 
 
 
186 aa  80.5  9e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  33.99 
 
 
188 aa  80.5  1e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  34.62 
 
 
551 aa  80.5  1e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  35.9 
 
 
172 aa  80.5  1e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  34.62 
 
 
454 aa  79.7  2e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  37.74 
 
 
178 aa  79.7  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  32.48 
 
 
168 aa  79  3e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.98 
 
 
594 aa  79.3  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  35.06 
 
 
180 aa  79  3e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.083399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>