More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10480 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_10480  predicted protein  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00789821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1142  RNA psedouridine synthase  46.63 
 
 
228 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0099  pseudouridine synthase Rlu family protein  45 
 
 
224 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000500513  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0288  pseudouridine synthase Rlu family protein  45.25 
 
 
230 aa  164  7e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003802  pseudouridylate synthase LSU rRNA-specific  45.25 
 
 
230 aa  162  2e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0399  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.13 
 
 
229 aa  161  4e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0325553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0295  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.13 
 
 
230 aa  161  4e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.859464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0296  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.13 
 
 
230 aa  161  5e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0300  pseudouridine synthase Rlu family protein, TIGR01621  44.13 
 
 
230 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02690  hypothetical protein  44.69 
 
 
230 aa  160  8e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0284  pseudouridine synthase Rlu family protein  45 
 
 
229 aa  160  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.44017e-05  hitchhiker  3.09962e-08 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1273  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.69 
 
 
235 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3738  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.44 
 
 
228 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.605712  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1290  pseudouridine synthase Rlu family protein, TIGR01621  45.76 
 
 
237 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1328  pseudouridine synthase RluA-like  45.74 
 
 
238 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0092  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.89 
 
 
225 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.752208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1318  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.17 
 
 
242 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0283  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.89 
 
 
228 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23479e-09 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4108  pseudouridine synthase Rlu family protein  42.78 
 
 
229 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4781  pseudouridine synthase Rlu family protein  45.45 
 
 
224 aa  152  3e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  unclonable  1.01532e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4390  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.33 
 
 
224 aa  151  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.80203e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1929  pseudouridine synthase Rlu family protein  48.04 
 
 
223 aa  151  6e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.975546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0111  pseudouridine synthase RluA-like protein  42.86 
 
 
226 aa  150  9e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1363  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.32 
 
 
238 aa  148  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3245  pseudouridine synthase  44.71 
 
 
232 aa  145  2e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4080  pseudouridine synthase Rlu family protein  41.85 
 
 
230 aa  146  2e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3536  pseudouridine synthase RluA-like protein  43.33 
 
 
224 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02767  tRNA pseudouridine synthase A  38.32 
 
 
279 aa  139  2e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1914  copper-resistance protein CopA  49.25 
 
 
209 aa  137  9e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.290092  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48756  predicted protein  39.02 
 
 
383 aa  114  1e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0290752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0035  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  38.83 
 
 
221 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  34.72 
 
 
325 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  32.8 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1622  pseudouridine synthase, RluD  33.7 
 
 
363 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5337  pseudouridine synthase  33.51 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.588803  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.03 
 
 
330 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  36.63 
 
 
329 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  32.16 
 
 
329 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2234  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (rRNA uridine isomerase C) (rRNA pseudouridylate synthase C)  33.16 
 
 
315 aa  91.3  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0928032  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0556  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.8 
 
 
305 aa  90.9  8e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0783  pseudouridine synthase, RluD  30.93 
 
 
323 aa  90.9  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  32.16 
 
 
330 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  31.63 
 
 
327 aa  89.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1648  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.14 
 
 
327 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  34.5 
 
 
319 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.71 
 
 
332 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1014  RluA family pseudouridine synthase  35.11 
 
 
307 aa  89  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1044  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
346 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0988  pseudouridine synthase  35.68 
 
 
574 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.31 
 
 
316 aa  88.2  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3541  pseudouridine synthase  33.87 
 
 
219 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.65216e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4402  pseudouridine synthase  36.32 
 
 
570 aa  87.8  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  32.49 
 
 
314 aa  87.8  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1931  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.94 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.176665  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  30.93 
 
 
307 aa  87.8  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1495  pseudouridine synthase, RluA family  32.61 
 
 
354 aa  87.8  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0102  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108549  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  31.69 
 
 
306 aa  87.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00059  hypothetical protein  33.87 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00251996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0105  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.72444e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3599  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199705  unclonable  1.50238e-08 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00060  pseudouridine synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32)  33.87 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00103207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0062  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.19589e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0060  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  2.46696e-08  normal  0.920561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0101  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00188355  normal  0.0335495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0060  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.57754e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0107  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000191196  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0100  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  32.28 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  0.810633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.57 
 
 
307 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  34.41 
 
 
299 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  37.14 
 
 
306 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1184  ribosomal large subunit pseudouridylate synthase D  34.57 
 
 
307 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0063  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
219 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0156615  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.63 
 
 
308 aa  87  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0018  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (rRNA-uridine isomerase D)  31.49 
 
 
326 aa  86.7  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1382  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.17 
 
 
307 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.53631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1446  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  34.57 
 
 
307 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3301  pseudouridine synthase  35.05 
 
 
574 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1206  RNA pseudouridylate synthase  36.17 
 
 
307 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.575901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1405  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.57 
 
 
307 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1304  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  36.17 
 
 
307 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0050  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
219 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.37271e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.69 
 
 
314 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1000  pseudouridine synthase  34.54 
 
 
574 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0447  pseudouridylate synthase  33.67 
 
 
222 aa  85.5  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  31.12 
 
 
330 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  32.61 
 
 
295 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1091  pseudouridine synthase  34.54 
 
 
574 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  35.23 
 
 
469 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  29.51 
 
 
235 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1058  pseudouridine synthase  34.02 
 
 
574 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.26 
 
 
307 aa  85.1  5e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  34.85 
 
 
341 aa  85.1  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0655  pseudouridine synthase  31.58 
 
 
241 aa  84.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  30.16 
 
 
339 aa  84.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.71 
 
 
308 aa  84.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  34.04 
 
 
305 aa  84  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  32.46 
 
 
308 aa  83.6  1e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.16 
 
 
315 aa  84  1e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.09224e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.64 
 
 
403 aa  83.6  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>