250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10404 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_10404  ClpYQ (HslUV)-type protease, proteolytic subunit HSLV (ClpQ)  100 
 
 
200 aa  411  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 
182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 
199 aa  231  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 
184 aa  230  9e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.16 
 
 
190 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 
187 aa  226  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.09 
 
 
186 aa  224  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.91 
 
 
176 aa  224  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
184 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 
186 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.91 
 
 
176 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
184 aa  219  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
184 aa  218  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 
186 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.88 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
183 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
188 aa  217  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.78 
 
 
187 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
182 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
188 aa  215  4e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
184 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.38 
 
 
193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.46 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
187 aa  211  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
185 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.05 
 
 
175 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.5 
 
 
189 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.17 
 
 
204 aa  208  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.17 
 
 
181 aa  208  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.22 
 
 
189 aa  208  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
191 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 
185 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
183 aa  205  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.85 
 
 
189 aa  205  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
185 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
197 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
189 aa  203  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
185 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 
176 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.49 
 
 
183 aa  201  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
184 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  55.09 
 
 
180 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.47 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.21 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
182 aa  198  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.93 
 
 
173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.91 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.93 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.6 
 
 
178 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
185 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.42 
 
 
175 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
176 aa  194  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 
185 aa  194  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
174 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.69 
 
 
179 aa  193  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.05 
 
 
178 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
181 aa  193  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  193  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
185 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 
183 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.18 
 
 
178 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21135  predicted protein  56.88 
 
 
174 aa  192  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0706268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.71 
 
 
174 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.71 
 
 
174 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.71 
 
 
174 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.25 
 
 
184 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.1 
 
 
174 aa  191  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.09 
 
 
176 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
181 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  49.72 
 
 
188 aa  191  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.34 
 
 
179 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.08 
 
 
176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.27 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.08 
 
 
176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.08 
 
 
176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.25 
 
 
176 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
176 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  54.97 
 
 
179 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.49 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>