More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10376 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009370  OSTLU_10376  predicted protein  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0125267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4664  RNA pseudouridine synthase family protein  37.82 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000338172 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4446  RNA pseudouridylate synthase  37.82 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4792  RNA pseudouridine synthase family protein  37.82 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4284  pseudouridylate synthase  37.39 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4674  RNA pseudouridylate synthase family protein  37.82 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13855  predicted protein  45.61 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.690932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4295  tRNA pseudouridine synthase A  36.97 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.502862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01765  RNA pseudouridine synthase family protein  39.5 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00504065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0577  RNA pseudouridine synthase family protein  36.55 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4379  pseudouridine synthase  36.55 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4661  RNA pseudouridine synthase family protein  36.97 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4677  RNA pseudouridine synthase family protein  36.55 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0916  RNA pseudouridine synthase family protein  37.76 
 
 		 314 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2613  RNA pseudouridine synthase family protein  35.71 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0782  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  36.82 
 
 		 324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168526  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2299  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  35.71 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2242  pseudouridine synthase  38.49 
 
 		 318 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3238  pseudouridine synthase  37.39 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.643571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3069  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1646  pseudouridine synthase, Rsu  36.4 
 
 		 317 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2990  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2417  RNA pseudouridylate synthase family protein  36.91 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2488  RNA pseudouridine synthase family protein  36.91 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2403  RNA pseudouridine synthase family protein  36.91 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2221  RNA pseudouridylate synthase  36.91 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2160  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  36.91 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.28876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2144  tRNA pseudouridine synthase A  36.91 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2386  RNA pseudouridine synthase family protein  36.91 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6011  pseudouridine synthase  36.97 
 
 		 389 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2974  RNA pseudouridine synthase family protein  36.91 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2192  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.13 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2938  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2353  RNA pseudouridine synthase family protein  36.48 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1235  pseudouridine synthase  35.29 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0316242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2928  pseudouridine synthase  35.56 
 
 		 477 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1204  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  35.12 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.501525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  35.29 
 
 		 314 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0855  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 332 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0908  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 328 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.500296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0944  pseudouridine synthase, Rsu  35.47 
 
 		 261 aa  134  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000200951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1367  pseudouridine synthase  33.89 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0778  pseudouridine synthase  37.92 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.132612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01258  pseudouridylate synthase  35.15 
 
 		 384 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004196  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  35.56 
 
 		 385 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00815873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12681  pseudouridine synthase, Rsu  35.17 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.850167  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0601  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  34.76 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.624758  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14081  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  34.76 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0236  pseudouridine synthase  33.48 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1748  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13243  pseudouridine synthase, Rsu  38.2 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4604  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4405  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.15276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4530  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.115437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0603  23S rRNA pseudouridine synthase F  32.64 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.10967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4444  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.71 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4528  23S rRNA pseudouridine synthase F  35.29 
 
 		 289 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.358582 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12611  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  35.24 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12541  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  32.78 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.558344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  37.13 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3586  pseudouridine synthase  34.6 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280598  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3854  pseudouridine synthase  32.77 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0226  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.03 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387458  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0917  pseudouridine synthase, Rsu  34.31 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0922  pseudouridine synthase  35.54 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03894  23S rRNA pseudouridine synthase  34.45 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3975  pseudouridine synthase  34.45 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0685  pseudouridine synthase, Rsu  35.1 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1834  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  35.19 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.954651  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03854  hypothetical protein  34.45 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3582  pseudouridine synthase  34.45 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3385  pseudouridine synthase  35.39 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0902  pseudouridine synthase  34.84 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1151  RNA pseudouridine synthase family protein  31.93 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000576228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3815  23S rRNA pseudouridine synthase F  36.4 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4008  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.098553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1816  pseudouridine synthase family 1 protein  35.15 
 
 		 340 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5500  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4483  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.429263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4566  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4258  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.45 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.520843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3461  pseudouridine synthase  35.34 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4525  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.03 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0952  pseudouridine synthase, Rsu  33.89 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.823269  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3971  23S rRNA pseudouridine synthase F  34.03 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  31.09 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1005  RNA-binding S4 domain protein  31.38 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.0262199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  35.86 
 
 		 309 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1167  RNA-binding S4 domain protein  34.17 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1442  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.02 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000380815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0916  pseudouridine synthase, Rsu  33.61 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.659376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0572  pseudouridine synthase, Rsu  33.2 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3180  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.69 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.74 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1228  pseudouridine synthase  35.71 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481726  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  36.56 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  36.56 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  34.3 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2937  pseudouridine synthase, Rsu  33.87 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>