More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10027 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  100 
 
 
668 aa  1356  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  2.99968e-06  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  36.67 
 
 
962 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  34.33 
 
 
989 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 
1002 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  36.24 
 
 
1015 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  35.38 
 
 
908 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  37.55 
 
 
593 aa  276  9e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  33.78 
 
 
1671 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  35.48 
 
 
538 aa  273  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  32.34 
 
 
742 aa  251  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  31.22 
 
 
735 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  30.42 
 
 
726 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  30.07 
 
 
709 aa  233  7e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  34.56 
 
 
795 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  35.66 
 
 
750 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  31.56 
 
 
718 aa  220  7e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  33.55 
 
 
825 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  33.49 
 
 
705 aa  215  2e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  30.21 
 
 
702 aa  210  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  29.98 
 
 
791 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  28.86 
 
 
770 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  33.33 
 
 
751 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  29.87 
 
 
795 aa  201  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.70881e-07  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  29.9 
 
 
667 aa  199  1e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  29.42 
 
 
705 aa  197  4e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.08449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  30.3 
 
 
794 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  29.63 
 
 
791 aa  195  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  28.31 
 
 
709 aa  194  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.15062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30 
 
 
762 aa  193  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  28.76 
 
 
751 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  29.47 
 
 
706 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  29.56 
 
 
716 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  28.93 
 
 
751 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  30.89 
 
 
770 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  31.5 
 
 
795 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  30.02 
 
 
1374 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.99 
 
 
706 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.33488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  25.9 
 
 
762 aa  185  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.17995e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  27.87 
 
 
737 aa  185  2e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  28.14 
 
 
737 aa  184  4e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  32.96 
 
 
863 aa  184  5e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  26.31 
 
 
758 aa  184  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  28.21 
 
 
792 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  30.62 
 
 
701 aa  181  3e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  28.08 
 
 
752 aa  180  6e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  25.41 
 
 
814 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  31.54 
 
 
1182 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  25.16 
 
 
806 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  25.2 
 
 
804 aa  176  1e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.93308e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  29.97 
 
 
813 aa  176  1e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  24.56 
 
 
792 aa  175  2e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  25.47 
 
 
812 aa  175  2e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  25.47 
 
 
808 aa  175  2e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  25.47 
 
 
806 aa  175  2e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  25.32 
 
 
808 aa  175  2e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  25.32 
 
 
808 aa  175  2e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.23572e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  25.47 
 
 
810 aa  175  3e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  24.96 
 
 
806 aa  174  6e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  29.07 
 
 
801 aa  173  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  27.63 
 
 
766 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  26.9 
 
 
704 aa  171  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.81 
 
 
759 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  27.24 
 
 
757 aa  170  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  27.11 
 
 
777 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2663  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.91 
 
 
833 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  32.06 
 
 
810 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  28.19 
 
 
694 aa  168  3e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  1.44778e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  27.65 
 
 
790 aa  168  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  27.65 
 
 
790 aa  168  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  33.63 
 
 
842 aa  167  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  26.87 
 
 
763 aa  167  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  25.73 
 
 
788 aa  166  1e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  26.56 
 
 
692 aa  165  2e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  25.58 
 
 
695 aa  165  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.96455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  26.42 
 
 
763 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  34.09 
 
 
535 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.24 
 
 
722 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  24.6 
 
 
708 aa  161  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  29.46 
 
 
896 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  29.46 
 
 
886 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  30.04 
 
 
812 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  29.46 
 
 
896 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  30.04 
 
 
838 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  30.04 
 
 
838 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  30.04 
 
 
838 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.97 
 
 
756 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  33.75 
 
 
754 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.6 
 
 
710 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.6 
 
 
710 aa  160  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  31.32 
 
 
834 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  30.17 
 
 
876 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  28.17 
 
 
810 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0050  ribonuclease R  32.66 
 
 
750 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82373  Exosomal 3'-5' exoribonuclease complex, subunit Rrp44/Dis3  26.49 
 
 
1251 aa  157  5e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0228634  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  27.73 
 
 
827 aa  157  5e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0356  ribonuclease R  32.37 
 
 
778 aa  157  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  29.46 
 
 
895 aa  157  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  7.14577e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.35 
 
 
716 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  29.09 
 
 
817 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  29.09 
 
 
817 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>