46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1847 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1847  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.16 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1538  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1545  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.87406e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0922  tRNA-His  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.543138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>