92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1794 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  50.36 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1510  UspA domain-containing protein  50.69 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.285079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1791  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.54 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  37.14 
 
 		 155 aa  103  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000238748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.77 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  27.86 
 
 		 166 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  30.99 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  25.97 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.89 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  25.17 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.57 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  28.08 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  26.06 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  29.45 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.76 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.1 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.05 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  27.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.06 
 
 		 281 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  28.05 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.79 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.76 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  28.1 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  23.9 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  27.5 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  27.59 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  25.85 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  24.46 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  27.39 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  27.33 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  26.8 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  26.39 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  26.17 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  27.19 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  27.7 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25 
 
 		 304 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  26.53 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  25 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  27.78 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.58 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  27.04 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.66 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3285  UspA domain protein  26.87 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  29.66 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  25.85 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  26.03 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  24.36 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  28 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  26.71 
 
 		 157 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 143 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 137 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.12 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  29.66 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  26.03 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  27.45 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 159 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>