More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1682 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  100 
 
 
458 aa  903    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  67.71 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  43.67 
 
 
484 aa  365  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.7 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  38.89 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  37.03 
 
 
507 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  38.22 
 
 
459 aa  292  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.16 
 
 
492 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  38.85 
 
 
446 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  38.05 
 
 
468 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.19 
 
 
477 aa  282  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  39.33 
 
 
480 aa  282  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  38.73 
 
 
463 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  38.51 
 
 
463 aa  279  8e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  37.31 
 
 
476 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  35.47 
 
 
478 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  36.7 
 
 
466 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  37.06 
 
 
464 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  37.06 
 
 
464 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  37.06 
 
 
464 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  37.06 
 
 
464 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  37.06 
 
 
464 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  40.27 
 
 
468 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  37.33 
 
 
465 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  37.88 
 
 
480 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  36.56 
 
 
464 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  36.56 
 
 
464 aa  269  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  36.34 
 
 
464 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  36.15 
 
 
468 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.01 
 
 
468 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.98 
 
 
448 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  39.11 
 
 
447 aa  264  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  36.11 
 
 
533 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  38.21 
 
 
472 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  35.41 
 
 
480 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  35.51 
 
 
441 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  37.13 
 
 
444 aa  259  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  34.48 
 
 
544 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  36.51 
 
 
485 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.22 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  36.15 
 
 
474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  38.15 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  38.15 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.53 
 
 
480 aa  253  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  37.05 
 
 
452 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  36.64 
 
 
479 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  36.12 
 
 
480 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  34.06 
 
 
480 aa  250  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  34.64 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  36.63 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  36.36 
 
 
468 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  37.19 
 
 
450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  35.62 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  34.64 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  34.64 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  35.22 
 
 
497 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  34.64 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  34.81 
 
 
449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  34.64 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  34.64 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  34.64 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  36.32 
 
 
474 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  35.86 
 
 
471 aa  242  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  38.41 
 
 
473 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  34.8 
 
 
480 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  35.25 
 
 
472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  35.25 
 
 
472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.85 
 
 
473 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  37.97 
 
 
473 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  35.25 
 
 
472 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  35.25 
 
 
472 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  35.25 
 
 
472 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  35.25 
 
 
472 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  35.25 
 
 
472 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  32.43 
 
 
499 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  35.25 
 
 
472 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.14 
 
 
466 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  34.9 
 
 
471 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  34.9 
 
 
471 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  35.03 
 
 
472 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  34.9 
 
 
471 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  36 
 
 
468 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.84 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.84 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  32.41 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.84 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.84 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  33.78 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  35.78 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  34.29 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  35.84 
 
 
472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.33 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  33.12 
 
 
472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>