49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1677 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1677  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0019  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.7 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0664  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0491998  hitchhiker  0.00288999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.83 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0968  hypothetical protein  50.94 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.107423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.28 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0203  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.06 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1123  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.15 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.435066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.17 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0525  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.3 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.17 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  47.17 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  42.59 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.3 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0303  hypothetical protein  45.28 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  47.17 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  47.17 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289705  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4870  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  47.17 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4957  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  47.17 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4905  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  47.17 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3616  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.06 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1416  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.51 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0219  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.3 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303284 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.59 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.361078 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6129  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.59 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684201  normal  0.245919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.44 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  47.17 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4680  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.31 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.59 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4026  hypothetical protein  41.51 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46740  hypothetical protein  41.51 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932046  decreased coverage  0.000000141029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2368  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  41.51 
 
 
153 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0686  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.23 
 
 
188 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3822  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.23 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.808721  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2579  YbaK  38.89 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1464  putative ebsC protein  38.89 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1661  putative ebsC protein  38.89 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2443  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  38.89 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0316  putative ebsC protein  38.89 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129099  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0284  putative ebsC protein  38.89 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.663414  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0580  ebsC protein, putative  39.62 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0881  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  39.62 
 
 
202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.37 
 
 
157 aa  43.5  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0527  hypothetical protein  45.24 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1396  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.74 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.22 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.23 
 
 
151 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.19 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.51 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>