More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1596 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1596  biotin operon repressor  100 
 
 
329 aa  668  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.31655e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0734  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.34 
 
 
323 aa  256  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.299053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0301  biotin operon repressor  39.21 
 
 
327 aa  250  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0518  biotin operon repressor  41.18 
 
 
325 aa  246  5e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0966787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1952  biotin operon repressor  38.82 
 
 
323 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  37.54 
 
 
328 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  38.46 
 
 
328 aa  214  2e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0054  hypothetical protein  37.07 
 
 
319 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0287578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1754  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.7 
 
 
327 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2779  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.07 
 
 
325 aa  185  1e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0162859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0830  biotin--protein ligase  36.36 
 
 
311 aa  180  3e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.676467  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2684  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.02 
 
 
405 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0888336  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.6 
 
 
326 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.44 
 
 
329 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.42 
 
 
329 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1136  biotin--protein ligase  33.02 
 
 
312 aa  158  9e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0797073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.61 
 
 
326 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2585  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.53 
 
 
338 aa  147  2e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  6.43253e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  32.62 
 
 
326 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  32.2 
 
 
326 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  32.2 
 
 
326 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  32.2 
 
 
326 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0041  birA bifunctional protein  31.7 
 
 
352 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.87 
 
 
326 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07370  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  33.12 
 
 
332 aa  145  8e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  5.66616e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  32.2 
 
 
326 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  31.56 
 
 
326 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2610  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.72 
 
 
335 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.808481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.19 
 
 
326 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  32.2 
 
 
326 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.78 
 
 
326 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.89 
 
 
326 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0793  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.67 
 
 
336 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30 
 
 
335 aa  140  2e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.58 
 
 
328 aa  140  4e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.63 
 
 
329 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.56 
 
 
338 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  30.34 
 
 
323 aa  137  3e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.8 
 
 
336 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.10207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.03 
 
 
332 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.63 
 
 
323 aa  132  7e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.12 
 
 
330 aa  132  1e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.62 
 
 
329 aa  130  4e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  28.66 
 
 
327 aa  129  7e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.97 
 
 
327 aa  129  8e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0125  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.15 
 
 
325 aa  129  9e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.98422e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00660  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  30 
 
 
326 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.17 
 
 
333 aa  126  4e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1476  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.44 
 
 
338 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.841583  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.33 
 
 
333 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.21 
 
 
327 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.71 
 
 
324 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2191  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.41 
 
 
327 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.57 
 
 
327 aa  122  1e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1476  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.8 
 
 
330 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.24 
 
 
321 aa  119  8e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  29.26 
 
 
326 aa  118  1e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1571  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.48 
 
 
330 aa  119  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.929422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0131  hypothetical protein  27.44 
 
 
328 aa  118  2e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2388  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.1 
 
 
330 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0131534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1015  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.65 
 
 
326 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.9 
 
 
326 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.16 
 
 
328 aa  116  7e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3720  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.97 
 
 
344 aa  115  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.071565  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1026  birA bifunctional protein  27.88 
 
 
323 aa  115  1e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.812765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2576  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.08 
 
 
310 aa  115  1e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1648  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.94 
 
 
326 aa  114  2e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.53 
 
 
317 aa  114  2e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  1.15964e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.85 
 
 
326 aa  114  2e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.22 
 
 
332 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  3.12804e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.95 
 
 
328 aa  112  7e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  28.88 
 
 
325 aa  112  8e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.28901e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1479  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.17 
 
 
329 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0876973  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1000  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.05 
 
 
332 aa  112  1e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2669  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.13 
 
 
312 aa  111  1e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.02 
 
 
318 aa  112  1e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.53 
 
 
326 aa  111  1e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.41219e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  28.62 
 
 
332 aa  110  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  1.81101e-07 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1081  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.96 
 
 
315 aa  111  2e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.560256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  30.12 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  27.01 
 
 
323 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  31.45 
 
 
333 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  27.01 
 
 
323 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  27.91 
 
 
331 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  29.3 
 
 
333 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  28.3 
 
 
331 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  27.33 
 
 
319 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1789  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.21 
 
 
326 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  27.88 
 
 
319 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.98 
 
 
329 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  29.87 
 
 
321 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.91 
 
 
343 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  27.02 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  28.75 
 
 
320 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  30.03 
 
 
320 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  29.77 
 
 
312 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  6.64696e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  29.51 
 
 
320 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0209  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.23 
 
 
314 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  29.05 
 
 
319 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  29.05 
 
 
319 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>