More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1560 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  100 
 
 
272 aa  564  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  49.61 
 
 
274 aa  250  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  46.09 
 
 
277 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
273 aa  228  6e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
283 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
287 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  43.25 
 
 
278 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
279 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 
278 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  43.01 
 
 
277 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
278 aa  203  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
276 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
291 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  39.33 
 
 
275 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
314 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
280 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
267 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
317 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  38.6 
 
 
283 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
338 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  38.6 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
285 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
277 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
300 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
272 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 
268 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
273 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
273 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
305 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
272 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
275 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
285 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
256 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
269 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.72 
 
 
275 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
256 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.82 
 
 
281 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
277 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
268 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
272 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 
277 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
274 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.566355  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 
270 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 
268 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
291 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
271 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 
291 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  32.49 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
291 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 
268 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
281 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  32.85 
 
 
281 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
268 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
291 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
277 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.191089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
267 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
271 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
270 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
285 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
268 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
275 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.35 
 
 
270 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>