54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1530 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  279  9e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1668  XRE family transcriptional regulator  53.08 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00903838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
137 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 
231 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
281 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  47.76 
 
 
301 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  39.44 
 
 
220 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  38.36 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  35.82 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  38.36 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.03 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  31.03 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
264 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.92 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
143 aa  43.5  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  28.44 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  33.87 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.88 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
380 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  33.85 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  36.62 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.43 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.43 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
242 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.81 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  30.95 
 
 
125 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  30.95 
 
 
125 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  30.95 
 
 
125 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  30.95 
 
 
125 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  30.95 
 
 
125 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>