More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1425 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  100 
 
 		 233 aa  476  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  63.04 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  60.35 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  57.92 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.38 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.95 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  53.51 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  52.19 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  50.65 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  50.45 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.65 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  51.74 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  51.74 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  45.3 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  45.3 
 
 		 289 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.62 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  49.57 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.32 
 
 		 315 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.16 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.21 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  46.32 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  47.86 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  45.96 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.79 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.2 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  41.2 
 
 		 323 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.06 
 
 		 387 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.95 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.95 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.87 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  42.67 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.24 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  41.3 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  39.39 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.1 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  44.29 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.44 
 
 		 542 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  38.79 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.86 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.09 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.75 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 288 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  40.89 
 
 		 536 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  38.86 
 
 		 242 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.54 
 
 		 349 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.5 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.5 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.83 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.63 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.21 
 
 		 652 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  35.53 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.89 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.55 
 
 		 326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  37.17 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.72 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41 
 
 		 416 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.61 
 
 		 335 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.34 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.41 
 
 		 442 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  39.91 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  42.78 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.33 
 
 		 413 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.53 
 
 		 519 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.53 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.05 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  38.86 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.86 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.22 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  34.8 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  42.71 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.24 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  37.77 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  37.77 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  37.44 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  40.86 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.78 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.49 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  37 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  36.56 
 
 		 372 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  37 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.69 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.69 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.16 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  36.64 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  36.09 
 
 		 323 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.16 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.17 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  38.72 
 
 		 314 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>