More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1316 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.1083e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  89.05 
 
 
137 aa  237  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  3.18944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 
137 aa  228  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.6487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  227  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.99342e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  82.48 
 
 
137 aa  227  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  80.88 
 
 
140 aa  226  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  8.14574e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.28293e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  80.88 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.59587e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.47316e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 
137 aa  224  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.8493e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  80.88 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  4.25498e-10  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.68481e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.55228e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  80.88 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.51619e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.43353e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  83.58 
 
 
135 aa  223  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  9.39126e-15 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 
137 aa  221  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  80.88 
 
 
139 aa  219  8e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.42047e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  82.44 
 
 
140 aa  218  2e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  78.68 
 
 
137 aa  218  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
137 aa  215  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.31582e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
137 aa  215  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  1.32236e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  75.91 
 
 
137 aa  207  4e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 
146 aa  203  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.46161e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
139 aa  203  8e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  73.19 
 
 
140 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  7.26978e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 
151 aa  201  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  1.89693e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
145 aa  199  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  2.5178e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
141 aa  200  7e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  74.63 
 
 
135 aa  199  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  9.30962e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
142 aa  198  2e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  4.51595e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
140 aa  197  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.97858e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 
142 aa  197  4e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.04201e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
128 aa  191  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  3.91683e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
123 aa  188  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
126 aa  187  3e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  8.79391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
126 aa  187  3e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 
124 aa  187  5e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
138 aa  186  8e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  186  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.29313e-06  hitchhiker  3.34928e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  186  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  70.92 
 
 
141 aa  186  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  71.32 
 
 
142 aa  185  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
123 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  2.84598e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
123 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
137 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.69822e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  3.85897e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
124 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  184  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.16882e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0863  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
125 aa  184  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  184  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.77595e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
124 aa  184  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.30102e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  184  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  3.29491e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  184  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.89821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  184  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.38987e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  183  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  1.86467e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
124 aa  183  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  1.01857e-06 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  183  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  6.71738e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  182  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  9.3676e-11 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
136 aa  182  1e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  182  1e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  182  1e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  4.80785e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  182  1e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  182  1e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  4.1416e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  182  1e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
125 aa  182  1e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.75958e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  182  1e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
125 aa  182  1e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.34966e-11  unclonable  8.17173e-08 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
125 aa  182  1e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  182  2e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.17432e-05  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
128 aa  182  2e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  7.03033e-07  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  182  2e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
124 aa  182  2e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
124 aa  182  2e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.00992e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
135 aa  181  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  181  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 
137 aa  181  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 
123 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  181  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
124 aa  181  4e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.03953e-07  decreased coverage  9.87169e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
124 aa  181  4e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  4.73434e-05  unclonable  2.78938e-12 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
125 aa  181  4e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
125 aa  181  4e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  8.13391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  70.99 
 
 
144 aa  180  5e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.35971e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  180  5e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  70.99 
 
 
144 aa  180  5e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  8.14349e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  70.99 
 
 
144 aa  180  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  9.45225e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
124 aa  180  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  179  8e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  2.49505e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
128 aa  179  8e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.94982e-05  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  179  8e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  69.12 
 
 
124 aa  179  9e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.70736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  179  9e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>