More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1027 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  51.1 
 
 
807 aa  729  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  47.97 
 
 
807 aa  723  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  48.96 
 
 
800 aa  710  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  51.1 
 
 
807 aa  729  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  51.1 
 
 
807 aa  729  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  53.51 
 
 
821 aa  851  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  48.96 
 
 
800 aa  710  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  51.65 
 
 
807 aa  721  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  52.04 
 
 
814 aa  753  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.51164e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  51.51 
 
 
807 aa  719  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  6.71952e-10 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  50.96 
 
 
807 aa  727  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.10274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  51.1 
 
 
807 aa  729  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  51.24 
 
 
807 aa  728  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  52.82 
 
 
819 aa  768  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  50.76 
 
 
814 aa  731  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  50.96 
 
 
807 aa  727  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  62.77 
 
 
812 aa  931  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  50.62 
 
 
824 aa  778  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  51.1 
 
 
807 aa  729  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  52.73 
 
 
806 aa  771  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
811 aa  1655  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  54.86 
 
 
826 aa  824  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  50.21 
 
 
800 aa  723  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  44.23 
 
 
908 aa  586  1e-166  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  43.45 
 
 
949 aa  580  1e-164  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.54 
 
 
899 aa  550  1e-155  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.14 
 
 
809 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  38.34 
 
 
809 aa  540  1e-152  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.79 
 
 
807 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  39.65 
 
 
848 aa  536  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  38.34 
 
 
809 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  40.03 
 
 
865 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  38.26 
 
 
809 aa  535  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.83 
 
 
807 aa  535  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  38.44 
 
 
833 aa  533  1e-150  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.06 
 
 
818 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  40.08 
 
 
866 aa  533  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.11 
 
 
852 aa  531  1e-149  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  39.97 
 
 
855 aa  527  1e-148  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.94 
 
 
839 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  40.22 
 
 
839 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.25 
 
 
818 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.9295e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  38.75 
 
 
825 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  38.44 
 
 
859 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  37.6 
 
 
848 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  41.14 
 
 
979 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  38.56 
 
 
812 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  41.14 
 
 
979 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.06 
 
 
796 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  38.66 
 
 
827 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  38.89 
 
 
809 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.73 
 
 
808 aa  519  1e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  38.02 
 
 
889 aa  518  1e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
852 aa  518  1e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  38.02 
 
 
889 aa  518  1e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  37.22 
 
 
806 aa  515  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  3.08081e-06  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  36.98 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  38.61 
 
 
856 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.47 
 
 
819 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  37.53 
 
 
821 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  37.4 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  38.1 
 
 
893 aa  515  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  35.7 
 
 
811 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  39.42 
 
 
816 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  39.34 
 
 
834 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  37.86 
 
 
811 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  37.58 
 
 
820 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39 
 
 
901 aa  510  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.44 
 
 
855 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.42 
 
 
827 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 
823 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 
879 aa  506  1e-142  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  38.96 
 
 
859 aa  508  1e-142  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  38.78 
 
 
827 aa  508  1e-142  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  38.73 
 
 
828 aa  507  1e-142  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  38.44 
 
 
824 aa  506  1e-142  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  38.04 
 
 
816 aa  508  1e-142  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  38.81 
 
 
815 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  38.7 
 
 
814 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.66151e-07  unclonable  1.53333e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.47 
 
 
809 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  39 
 
 
804 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  38.45 
 
 
828 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  9.29696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
870 aa  504  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  38.45 
 
 
827 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  39.14 
 
 
804 aa  505  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  37.41 
 
 
864 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  37.33 
 
 
932 aa  500  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  37.18 
 
 
899 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  35.77 
 
 
856 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  37.3 
 
 
856 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  38.6 
 
 
823 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  34.41 
 
 
860 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  38.13 
 
 
829 aa  502  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>