More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0976 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  60.76 
 
 
291 aa  360  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  54.79 
 
 
291 aa  328  9e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  56.55 
 
 
294 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  56.21 
 
 
294 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  54.3 
 
 
295 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  54.3 
 
 
295 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  54.3 
 
 
295 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  54.3 
 
 
295 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  54.3 
 
 
295 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  53.95 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  53.95 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  53.95 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  53.95 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  54.3 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  53.95 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  49.83 
 
 
293 aa  248  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  49.83 
 
 
293 aa  248  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  44.41 
 
 
341 aa  244  9e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  50 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  42.76 
 
 
289 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.64 
 
 
292 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.92 
 
 
294 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  43.3 
 
 
293 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  44.71 
 
 
297 aa  228  9e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.67 
 
 
289 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  44.37 
 
 
295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  43.84 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  45.89 
 
 
290 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  44.07 
 
 
292 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  42.73 
 
 
346 aa  222  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  42.66 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  44.73 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  42.86 
 
 
313 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  43.3 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.32 
 
 
292 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  45.33 
 
 
285 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  42.47 
 
 
346 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  43 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  44.98 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.66 
 
 
290 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  44.8 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  43.26 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  44.29 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  41.72 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.67 
 
 
291 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.67 
 
 
288 aa  209  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  44.9 
 
 
291 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  42.52 
 
 
286 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  44.64 
 
 
285 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  44.64 
 
 
285 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  44.64 
 
 
285 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.33 
 
 
311 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  44.79 
 
 
283 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  42.61 
 
 
292 aa  205  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  42.2 
 
 
294 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  42.16 
 
 
283 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.33 
 
 
294 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  42.16 
 
 
283 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  42.16 
 
 
283 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  42.16 
 
 
283 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  42.16 
 
 
283 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  43.15 
 
 
287 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  42.24 
 
 
308 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.74 
 
 
303 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  41.81 
 
 
283 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  41.38 
 
 
292 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  42.76 
 
 
308 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  40.48 
 
 
291 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  42.16 
 
 
283 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  43.49 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  41.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  42.47 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  43.29 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.2 
 
 
292 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  39.58 
 
 
293 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.81 
 
 
283 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  41.42 
 
 
308 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  39.93 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  39.93 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  41.42 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  41.28 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>