More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0975 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.99149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  71.26 
 
 
258 aa  381  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  68.25 
 
 
271 aa  356  2e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.78728e-13  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  69.96 
 
 
255 aa  355  5e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  65.49 
 
 
262 aa  348  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.50841e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  66.41 
 
 
256 aa  343  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  1.52831e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  66.67 
 
 
255 aa  343  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  63.2 
 
 
235 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  62.61 
 
 
235 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.68885e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  64.47 
 
 
235 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.51826e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  61.7 
 
 
238 aa  321  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.05725e-13  unclonable  1.05333e-08 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  62.55 
 
 
252 aa  320  1e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.28012e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  64.32 
 
 
233 aa  320  1e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.75862e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  63.32 
 
 
244 aa  319  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.37071e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  63.48 
 
 
233 aa  319  4e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.68536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  63.6 
 
 
257 aa  317  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.41904e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  60.26 
 
 
262 aa  315  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.93238e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  57.69 
 
 
255 aa  314  1e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.15088e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  62.61 
 
 
233 aa  314  1e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.62012e-10  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  62.61 
 
 
233 aa  314  1e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.30027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  57.69 
 
 
255 aa  314  1e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  4.66794e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  62.17 
 
 
233 aa  313  2e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.72591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.868e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.93043e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.91144e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  61.64 
 
 
232 aa  312  3e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.60898e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
233 aa  312  3e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  8.60084e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  62.71 
 
 
252 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.1714e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  60.25 
 
 
262 aa  308  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  60.53 
 
 
248 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.21925e-08  unclonable  2.22969e-10 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  59.48 
 
 
232 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.523e-12  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  60.53 
 
 
244 aa  304  9e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.85332e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  61.25 
 
 
280 aa  304  1e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  57.66 
 
 
257 aa  301  8e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.16198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  57.46 
 
 
265 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  61.33 
 
 
246 aa  298  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.59372e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  53.97 
 
 
264 aa  298  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  59.21 
 
 
236 aa  298  9e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.83579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  58.77 
 
 
288 aa  294  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  58.08 
 
 
281 aa  295  7e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.27244e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  55.47 
 
 
257 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  60.26 
 
 
233 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  9.41341e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  60.26 
 
 
233 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  4.87185e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  60.43 
 
 
251 aa  292  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
272 aa  291  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  58.59 
 
 
257 aa  289  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  58.7 
 
 
251 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.02151e-13  hitchhiker  3.84341e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  52.53 
 
 
269 aa  288  5e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  59.39 
 
 
256 aa  288  5e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.26335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  59.29 
 
 
274 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
251 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 
260 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47656e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
259 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  3.41164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  58.7 
 
 
255 aa  285  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  59.91 
 
 
243 aa  285  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  51.59 
 
 
268 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  51.59 
 
 
268 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
246 aa  285  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.4456e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08141  30S ribosomal protein S2  54.78 
 
 
234 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08131  30S ribosomal protein S2  54.78 
 
 
234 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  58.7 
 
 
255 aa  284  1e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  55.6 
 
 
245 aa  283  2e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.54346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 
262 aa  283  2e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.19331e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 
260 aa  283  2e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  9.40316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  58.15 
 
 
289 aa  283  3e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  53.71 
 
 
230 aa  282  4e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 
291 aa  281  5e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.18359e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  54.59 
 
 
238 aa  281  6e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  55.17 
 
 
245 aa  281  7e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.06427e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 
239 aa  281  7e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  60.26 
 
 
263 aa  281  8e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.55744e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08311  30S ribosomal protein S2  54.15 
 
 
234 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.419677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0123  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 
262 aa  281  9e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  53.71 
 
 
239 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  54.74 
 
 
245 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  2.47942e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1222  30S ribosomal protein S2  53.28 
 
 
238 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0761  30S ribosomal protein S2  54.15 
 
 
233 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  56.17 
 
 
316 aa  278  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  51.72 
 
 
262 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  56.96 
 
 
267 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.77478e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 
273 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  56.33 
 
 
301 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  1.23477e-06  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  54.85 
 
 
279 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  51.15 
 
 
262 aa  275  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 
284 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 
284 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 
284 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  55.83 
 
 
304 aa  275  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.36253e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07891  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 
222 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.992425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 
294 aa  272  5e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.45501e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  56.14 
 
 
282 aa  272  5e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  53.33 
 
 
324 aa  271  9e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  55.98 
 
 
272 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  55.7 
 
 
271 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  56 
 
 
248 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.97191e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  55.27 
 
 
289 aa  269  3e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  7.65471e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  55.98 
 
 
262 aa  269  3e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.23187e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>