More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0919 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  100 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  33.33 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  35.07 
 
 
486 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  36.65 
 
 
271 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  39.66 
 
 
228 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  40.99 
 
 
554 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  38.73 
 
 
342 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  43.75 
 
 
226 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  38.79 
 
 
487 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  32.02 
 
 
225 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  38.03 
 
 
342 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  38.79 
 
 
487 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  38.46 
 
 
569 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  30.92 
 
 
219 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  36.09 
 
 
519 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.47 
 
 
327 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.93 
 
 
365 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.5 
 
 
356 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  38.56 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  36.54 
 
 
386 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  38.22 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  37.8 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  39.26 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  38.46 
 
 
389 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  34.41 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  34.41 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  32.18 
 
 
625 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  49.48 
 
 
342 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 
625 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  38.41 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.38 
 
 
371 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  39.55 
 
 
396 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  39.06 
 
 
625 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.06 
 
 
625 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  38.04 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  37.16 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.93 
 
 
358 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  30.34 
 
 
356 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  33.33 
 
 
261 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  33.73 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  39.85 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  39.64 
 
 
511 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.33 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.33 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.33 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  39.24 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  36.89 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  39.16 
 
 
513 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  36.72 
 
 
625 aa  82.8  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  37.42 
 
 
556 aa  82  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  33.57 
 
 
303 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  39.71 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  37.32 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  41.58 
 
 
570 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  34.51 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  34.51 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.12 
 
 
579 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  41.26 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  34.29 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  48.15 
 
 
298 aa  79  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  30.39 
 
 
523 aa  79  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  32.1 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.34 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.76 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  33.57 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  43.75 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  32.17 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.17 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.17 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  33.58 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  32.17 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  34.56 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.04 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  33.58 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  33.56 
 
 
360 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  31.91 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  38.02 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.05 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  32.17 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  34.06 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  34.64 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  29.25 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.9 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  38.52 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  37.61 
 
 
515 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  35.97 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  27.23 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  31.45 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  34.44 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.12 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.21 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  30.72 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  41.05 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  34.97 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  37.72 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  35.09 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>