More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0806 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  59.46 
 
 
192 aa  226  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  56.52 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  52.17 
 
 
184 aa  189  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  45.5 
 
 
204 aa  175  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  45.88 
 
 
211 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  45.83 
 
 
204 aa  164  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  48.9 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  48.35 
 
 
183 aa  160  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  48.35 
 
 
183 aa  160  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  45.56 
 
 
208 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  46.11 
 
 
184 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  46.11 
 
 
184 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  44.57 
 
 
184 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  46.11 
 
 
184 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  46.59 
 
 
184 aa  157  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  45 
 
 
184 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  46.59 
 
 
184 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  46.59 
 
 
184 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  46.59 
 
 
184 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  46.59 
 
 
184 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  45.56 
 
 
184 aa  156  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  42.16 
 
 
184 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  42.41 
 
 
200 aa  104  7e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  36.47 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  31.67 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  31.69 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  36.52 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  33.53 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  34.25 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  35.15 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  35.33 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  37.7 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  33.91 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  35.63 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  34.1 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  34.34 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  33.54 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  34.34 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  32.74 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  32.93 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  32.93 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  32.18 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  32.74 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  30.69 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  31.98 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  32.53 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  36.59 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  33.54 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  32.32 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  34.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  31.71 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  32.62 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  36.81 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  34.08 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  31.33 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  33.54 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  31.52 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  30.18 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  32.76 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  32.12 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  38.46 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  32.54 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  33.13 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  33.72 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  30.95 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  31.93 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  31.76 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  32.32 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  33.92 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  30.36 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  34.25 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  34.55 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  34.36 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  32.35 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  34.55 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  30.68 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  36.97 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  32.16 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  31.55 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  36.2 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  31.03 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  29.88 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  32.93 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  29.35 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  35.94 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  31.03 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  33.53 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  31.38 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  33.33 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  32.12 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  31.18 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  32.93 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  33.71 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  32.18 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  34.12 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  32.35 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  32.2 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  31.58 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  32.3 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>