More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0771 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0771  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 
427 aa  878    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.129495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0667  diaminopimelate decarboxylase  60.1 
 
 
430 aa  535  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00422384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  56.77 
 
 
436 aa  510  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  51.44 
 
 
439 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  51.78 
 
 
439 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1342  diaminopimelate decarboxylase  49.03 
 
 
438 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.369143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1542  diaminopimelate decarboxylase  48.79 
 
 
438 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1302  diaminopimelate decarboxylase  48.55 
 
 
438 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1579  diaminopimelate decarboxylase  48.55 
 
 
438 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1473  diaminopimelate decarboxylase  48.55 
 
 
438 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1329  diaminopimelate decarboxylase  48.31 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1303  diaminopimelate decarboxylase  48.31 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1438  diaminopimelate decarboxylase  48.31 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1141  diaminopimelate decarboxylase  47.37 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1510  diaminopimelate decarboxylase  48.31 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3871  diaminopimelate decarboxylase  48.31 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.063243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  49.41 
 
 
443 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  47.24 
 
 
441 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  47.38 
 
 
445 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0576  diaminopimelate decarboxylase  44.87 
 
 
431 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.757685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  45.13 
 
 
434 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  44.63 
 
 
431 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  46.19 
 
 
447 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 
435 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  45.99 
 
 
434 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  43.23 
 
 
447 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  44.66 
 
 
421 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  45.39 
 
 
434 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  45.99 
 
 
434 aa  368  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  47.14 
 
 
437 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  43.6 
 
 
435 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0126  diaminopimelate decarboxylase  43.49 
 
 
474 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0123  diaminopimelate decarboxylase  43.49 
 
 
474 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.251884  normal  0.0757404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  43.9 
 
 
448 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  44.08 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  43.77 
 
 
421 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  43.77 
 
 
421 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3652  diaminopimelate decarboxylase  42.69 
 
 
470 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  41.9 
 
 
463 aa  352  8e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  46.62 
 
 
433 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  42.42 
 
 
461 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 
438 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0912  diaminopimelate decarboxylase  41.73 
 
 
464 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4034  diaminopimelate decarboxylase  42.17 
 
 
470 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  hitchhiker  0.00505776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1198  diaminopimelate decarboxylase  42.92 
 
 
465 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0279  diaminopimelate decarboxylase  41.18 
 
 
451 aa  346  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2435  diaminopimelate decarboxylase  42.82 
 
 
475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.588454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1229  diaminopimelate decarboxylase  42.03 
 
 
453 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  40.81 
 
 
464 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01670  diaminopimelate decarboxylase  40.66 
 
 
452 aa  339  5e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.209967  hitchhiker  0.000000000000581642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0842  diaminopimelate decarboxylase  41.4 
 
 
477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0309438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0317  diaminopimelate decarboxylase  40.05 
 
 
461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3726  diaminopimelate decarboxylase  41.08 
 
 
486 aa  335  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575274  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  40.38 
 
 
461 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0658  diaminopimelate decarboxylase  41.98 
 
 
454 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14901  diaminopimelate decarboxylase  41.98 
 
 
454 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.813083  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4702  diaminopimelate decarboxylase  41.18 
 
 
458 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29970  diaminopimelate decarboxylase  41.76 
 
 
479 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450757  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1900  diaminopimelate decarboxylase  40.23 
 
 
473 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4349  diaminopimelate decarboxylase  40.94 
 
 
476 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.204157 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 
459 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  42.65 
 
 
445 aa  328  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11811  diaminopimelate decarboxylase  43.23 
 
 
457 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09931  diaminopimelate decarboxylase  40.33 
 
 
455 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3897  diaminopimelate decarboxylase  40.71 
 
 
474 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3883  diaminopimelate decarboxylase  40.71 
 
 
474 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29281  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3971  diaminopimelate decarboxylase  40.71 
 
 
474 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  41.61 
 
 
455 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11971  diaminopimelate decarboxylase  41.29 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0878  diaminopimelate decarboxylase  41.06 
 
 
465 aa  319  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.109774  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11320  diaminopimelate decarboxylase lysA (dap decarboxylase)  40.05 
 
 
447 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  41.09 
 
 
448 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  42.08 
 
 
430 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11961  diaminopimelate decarboxylase  41.29 
 
 
457 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6157  diaminopimelate decarboxylase  41.12 
 
 
474 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1101  diaminopimelate decarboxylase  40.81 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1391  diaminopimelate decarboxylase  38.81 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5579  diaminopimelate decarboxylase  40.05 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19350  diaminopimelate decarboxylase  37.18 
 
 
470 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.28871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1814  diaminopimelate decarboxylase  39.29 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.040954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2297  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 
472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1251  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 
463 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254019  normal  0.196655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1053  diaminopimelate decarboxylase  38.41 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.861814  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09810  diaminopimelate decarboxylase  38.76 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4154  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 
496 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.753034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2093  diaminopimelate decarboxylase  39.16 
 
 
484 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000338796  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1637  diaminopimelate decarboxylase  38.22 
 
 
460 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00899819  normal  0.731678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2466  diaminopimelate decarboxylase  37.1 
 
 
463 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.093066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08010  diaminopimelate decarboxylase  37.47 
 
 
490 aa  299  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.426726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  38.06 
 
 
423 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5547  diaminopimelate decarboxylase  39.06 
 
 
468 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.208469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2624  diaminopimelate decarboxylase  35.46 
 
 
500 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1743  diaminopimelate decarboxylase  38.68 
 
 
466 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2357  diaminopimelate decarboxylase  36.59 
 
 
490 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000765789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0629  diaminopimelate decarboxylase  38.46 
 
 
500 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0587531  decreased coverage  0.000745702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0013  diaminopimelate decarboxylase  37.12 
 
 
443 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1280  diaminopimelate decarboxylase  37.62 
 
 
455 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199446  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1365  diaminopimelate decarboxylase  39.34 
 
 
423 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00386973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1792  diaminopimelate decarboxylase  36.53 
 
 
459 aa  278  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>