174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0758 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  25.68 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  25.68 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 180 aa  51.2  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  21.34 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  20.69 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  23.03 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  21.31 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  18.99 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  22.48 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  21.21 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  21.05 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 257 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  23.46 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  26.58 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  29.85 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  22.43 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.27 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  31.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  19.71 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  21.48 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  19.53 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  20.22 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  29.85 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  19.81 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 241 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 241 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  23.6 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0896  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00832617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 324 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>