47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0734 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  100 
 
 
353 aa  697    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  52.59 
 
 
350 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  53.41 
 
 
352 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  39.38 
 
 
348 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  43.38 
 
 
348 aa  242  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  42.54 
 
 
348 aa  238  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  42.54 
 
 
348 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  37.29 
 
 
349 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  37.29 
 
 
349 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  36.67 
 
 
356 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
349 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  29.33 
 
 
354 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  31.75 
 
 
357 aa  156  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 
354 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
354 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  29.05 
 
 
354 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  28.77 
 
 
354 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  28.77 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  29.05 
 
 
354 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  29.05 
 
 
354 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 
354 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 
350 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
380 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  23.96 
 
 
362 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 
368 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.16 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  21.88 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  23.68 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.41 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  24.02 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  24.02 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 
368 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  22.74 
 
 
380 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  18.7 
 
 
349 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  23.06 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  27.4 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  21.67 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 
833 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
831 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
878 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>