180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0660 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  100 
 
 
70 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  55.17 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  55.17 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  51.02 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  52.08 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4612  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.45 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  40.3 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40.3 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40.3 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 
96 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 
94 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  45.76 
 
 
89 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  52.38 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  52.17 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  42.55 
 
 
71 aa  50.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  42.65 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  42.59 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  39.71 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.45 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52210  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  42.59 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  34.33 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  45.59 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 
85 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  45.59 
 
 
82 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2592  ATP synthase F0, C subunit  51.11 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.130399  normal  0.0749616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3971  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000527403  normal  0.270101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  51.35 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000270119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1874  F0F1-type ATP synthase, subunit c  44.44 
 
 
75 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  41.18 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2387  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  42.19 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>