More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0616 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0616  translation initiation factor 1  100 
 
 		 72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756585  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 83 aa  103  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  68.06 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 73 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  65.28 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  62.5 
 
 		 73 aa  97.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  62.5 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 75 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  61.11 
 
 		 87 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 73 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 74 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1756  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3557  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.177852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 75 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 75 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  94.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  63.89 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 73 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2051  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2444  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.546311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>