More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0609 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 
178 aa  357  7e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  69.1 
 
 
178 aa  258  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
178 aa  230  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
178 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  60.11 
 
 
178 aa  223  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
178 aa  218  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 
176 aa  216  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 
178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
178 aa  208  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
178 aa  207  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  207  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  207  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
183 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  205  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.74 
 
 
181 aa  204  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  203  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
184 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 
177 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  54.24 
 
 
179 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.93 
 
 
180 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.8 
 
 
177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.29 
 
 
182 aa  194  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 
182 aa  194  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
178 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
178 aa  191  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
180 aa  190  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.37 
 
 
178 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  53.37 
 
 
180 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
178 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
178 aa  187  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 
180 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.56 
 
 
178 aa  187  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.14 
 
 
182 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.11 
 
 
179 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 
180 aa  186  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  51.67 
 
 
179 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 
178 aa  185  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.56 
 
 
178 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
177 aa  185  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  52.84 
 
 
178 aa  184  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  184  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 
179 aa  184  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 
179 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48.31 
 
 
177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  50.28 
 
 
177 aa  181  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.96 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  180  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  180  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  48.88 
 
 
178 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  49.14 
 
 
176 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 
179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
182 aa  178  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  50.85 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 
179 aa  177  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  177  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  47.43 
 
 
178 aa  177  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 
179 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 
179 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 
179 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  47.75 
 
 
178 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
176 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>