More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0601 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  77.67 
 
 		 223 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  68.08 
 
 		 221 aa  294  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  63.38 
 
 		 217 aa  277  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  63.38 
 
 		 217 aa  276  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  64.32 
 
 		 217 aa  276  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  63.38 
 
 		 218 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  62.44 
 
 		 218 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  63.38 
 
 		 226 aa  272  5.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  60.09 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  61.5 
 
 		 222 aa  262  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  59.15 
 
 		 219 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 		 217 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 		 217 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  58.41 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  56.81 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  55.87 
 
 		 221 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  55.87 
 
 		 220 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 236 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  54.93 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  51.4 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  49.17 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  49.17 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  54.21 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 243 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  52.77 
 
 		 232 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 232 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  53.21 
 
 		 238 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  50.2 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  49.03 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  52.14 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  49.58 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  51.83 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  49.58 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  48.76 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  53.67 
 
 		 228 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  49.15 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  51.79 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  51.27 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  51.5 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  51.5 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  53 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  52.23 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  53.27 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  51.79 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  52.23 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  52.23 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  52.23 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  53.27 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  48.73 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  51.64 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  53.46 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  48.13 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 222 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>