More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0598 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  2.63643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  86.02 
 
 
277 aa  488  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  76.9 
 
 
281 aa  425  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.49234e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  72.04 
 
 
277 aa  408  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  72.04 
 
 
277 aa  408  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  72.04 
 
 
277 aa  408  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 
276 aa  399  1e-110  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  71.94 
 
 
278 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4721e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  68.82 
 
 
277 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  69.68 
 
 
276 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 
277 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 
281 aa  381  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  68.59 
 
 
276 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  68.23 
 
 
276 aa  380  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  68.59 
 
 
276 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  68.23 
 
 
276 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  68.23 
 
 
276 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  67.87 
 
 
276 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  65.12 
 
 
281 aa  375  1e-103  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 
281 aa  360  2e-98  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  63.31 
 
 
276 aa  353  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  63.44 
 
 
276 aa  351  9e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  62.82 
 
 
275 aa  348  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  63.77 
 
 
276 aa  343  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 
280 aa  342  3e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 
275 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 
275 aa  341  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  63.8 
 
 
277 aa  337  2e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 
277 aa  335  4e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.95488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 
275 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  62.45 
 
 
273 aa  333  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 
281 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.72816e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
276 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  59.86 
 
 
277 aa  331  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  61.96 
 
 
275 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
275 aa  328  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 
275 aa  327  1e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  61.15 
 
 
275 aa  326  2e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 
277 aa  324  8e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 
277 aa  324  8e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
279 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  57.71 
 
 
279 aa  320  1e-86  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  59.93 
 
 
276 aa  320  1e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  59.21 
 
 
276 aa  320  2e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
277 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
276 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
276 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 
274 aa  315  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  58.78 
 
 
274 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.06039e-07  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 
275 aa  315  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
274 aa  313  2e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
273 aa  313  2e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  57.51 
 
 
287 aa  312  3e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  58.84 
 
 
276 aa  311  6e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  311  8e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  311  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  3.02361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
287 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 
274 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.15964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 
274 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.0829e-09  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.57775e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 
274 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12597e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.01214e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.37187e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.93877e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.2222e-06  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
273 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  60.69 
 
 
274 aa  309  3e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
273 aa  309  3e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.91678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 
287 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 
287 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
275 aa  308  7e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
283 aa  307  1e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  58.36 
 
 
278 aa  307  1e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.62145e-06  hitchhiker  6.63071e-07 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 
275 aa  305  5e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  6.88583e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 
275 aa  303  2e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.98645e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  60.43 
 
 
274 aa  302  3e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0436  50S ribosomal protein L2  55.76 
 
 
275 aa  302  4e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4687  50S ribosomal protein L2  59.5 
 
 
275 aa  302  5e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.99794e-06  unclonable  2.35543e-08 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 
273 aa  301  6e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  3.94369e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  54.87 
 
 
287 aa  301  7e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 
278 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 
278 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 
276 aa  299  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 
278 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 
279 aa  299  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>