More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0597 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  6.50952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  59.18 
 
 
98 aa  120  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.24124e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  59.78 
 
 
95 aa  112  2e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
98 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.28717e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  59.34 
 
 
95 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.41418e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
95 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.44838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
97 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.85087e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.88654e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  5.63087e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.62494e-10  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.56815e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.63853e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.1737e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.07631e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.86787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.45247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  49.48 
 
 
97 aa  90.1  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  6.52343e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  49.46 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
91 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.49169e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.27953e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.64247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 
98 aa  84.3  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
95 aa  82  3e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
95 aa  79.7  1e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
94 aa  77  7e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
95 aa  77  8e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 
101 aa  75.5  2e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 
98 aa  75.9  2e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.10962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
98 aa  74.7  4e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 
98 aa  73.9  7e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  47.56 
 
 
100 aa  73.6  8e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  4.09295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  47.56 
 
 
100 aa  73.6  8e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.1109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
94 aa  72.8  1e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  45.56 
 
 
95 aa  72.4  2e-12  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  3.56611e-09 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
94 aa  71.2  4e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  46.15 
 
 
95 aa  70.9  5e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  1.09599e-08 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 
98 aa  71.2  5e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  42.39 
 
 
96 aa  70.9  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
103 aa  70.9  6e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 
99 aa  70.5  8e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  42.7 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
95 aa  68.9  2e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  42.68 
 
 
94 aa  68.9  2e-11  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.8644e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 
99 aa  68.2  4e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.5981e-07  hitchhiker  4.76583e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 
117 aa  67.8  4e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.54231e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 
94 aa  67.8  5e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
94 aa  67.4  5e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 
97 aa  67.4  5e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.83803e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
94 aa  67.4  6e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  42.68 
 
 
95 aa  67  8e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
100 aa  67  8e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  43.62 
 
 
95 aa  67  8e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 
93 aa  67  8e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  6.79303e-05  hitchhiker  1.53425e-10 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
100 aa  67  9e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
100 aa  67  9e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
100 aa  67  9e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  43.02 
 
 
103 aa  66.2  1e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
103 aa  66.6  1e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
100 aa  66.2  1e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
103 aa  66.6  1e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
98 aa  66.6  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 
110 aa  66.6  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  42.17 
 
 
96 aa  65.9  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  41.18 
 
 
96 aa  66.2  2e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
96 aa  65.9  2e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
181 aa  65.5  3e-10  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
98 aa  65.1  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
95 aa  64.7  4e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.40996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  44.58 
 
 
94 aa  64.7  4e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.16587e-06  hitchhiker  9.56309e-13 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  41.38 
 
 
100 aa  63.9  6e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 
99 aa  64.3  6e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
100 aa  63.9  7e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
94 aa  63.2  1e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
100 aa  63.2  1e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 
101 aa  63.2  1e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  5.94054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
100 aa  62.4  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
97 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 
97 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  41.86 
 
 
97 aa  62.4  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
100 aa  62.4  2e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
97 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
100 aa  62.4  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  38.54 
 
 
98 aa  62.4  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 
117 aa  62.8  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  6.31754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  37.8 
 
 
94 aa  62  3e-09  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 
100 aa  62  3e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  40.23 
 
 
100 aa  61.6  3e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  39.77 
 
 
97 aa  61.6  3e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
100 aa  62  3e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  41.11 
 
 
98 aa  61.2  4e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  39.08 
 
 
100 aa  61.2  5e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
97 aa  60.8  5e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
97 aa  60.8  5e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  41.86 
 
 
100 aa  60.8  6e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
97 aa  60.8  6e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>