More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0578 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 338 aa  684    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.46 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.47 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.55 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.54 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 333 aa  394  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.54 
 
 		 541 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.27 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.27 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 332 aa  381  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.08 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4544  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.076063  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  54.95 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.65 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.43 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.21 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.27 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.35 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  54.27 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.86 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.95 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.32 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.23 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.28 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.68 
 
 		 338 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.84 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.43 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.91 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.54 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.54 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.54 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  54.24 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.29 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>