More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0478 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  100 
 
 		 480 aa  964    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  48.28 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  48.21 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  45.37 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  45.93 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  48.24 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  42.58 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  42.16 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  42.45 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  40.66 
 
 		 472 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  39.87 
 
 		 497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  39.58 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  39.66 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  41.39 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.36 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.36 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  37.11 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.02 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  39.29 
 
 		 462 aa  282  9e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.5 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.84 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  36.11 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.04 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  34.62 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  32.97 
 
 		 474 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.25 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  33.55 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  33.83 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.06 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  34.02 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34.81 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.84 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  31.36 
 
 		 491 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.06 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  34.84 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.23 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34 
 
 		 447 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  32.01 
 
 		 482 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.34 
 
 		 533 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.13 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  32.52 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.78 
 
 		 468 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  31.71 
 
 		 480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  30.13 
 
 		 478 aa  232  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  31.06 
 
 		 475 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.15 
 
 		 516 aa  230  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  32.75 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  28.97 
 
 		 544 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  27.67 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  31.13 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  27.67 
 
 		 471 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  27.67 
 
 		 471 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  30.87 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  32.26 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  31.84 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  31.29 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.42 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.58 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  30.21 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  32.53 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  31.86 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  31.97 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.58 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.07 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  32.58 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  32.07 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.39 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  32.07 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  32.07 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.07 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  30.97 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  30.17 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.79 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  30.77 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  31 
 
 		 480 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  32.89 
 
 		 473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  31.99 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  29.89 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  30.45 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  30.15 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  32.66 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  29.23 
 
 		 470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  32.61 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  32.61 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  30.63 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  29.57 
 
 		 485 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  29.81 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  34.99 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  32.04 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  28.81 
 
 		 497 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.83 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  30.31 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  29.45 
 
 		 474 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  31.15 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>