More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0457 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 507 aa  1019    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.53 
 
 		 491 aa  667    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.11 
 
 		 481 aa  617  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  61.37 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  56.89 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  55.53 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  54.63 
 
 		 520 aa  558  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  53.1 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  53.32 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  53.32 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  53.6 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  53.6 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  53.6 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  53.6 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  54.82 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  53.6 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  54.86 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  53.36 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  53.36 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  53.36 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  53.36 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  53.83 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.08 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  52.9 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  54.4 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.61 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  54.76 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  49.4 
 
 		 479 aa  458  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.3 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.14 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  52.67 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.72 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  53.68 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  52.27 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.93 
 
 		 448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  49.33 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  51 
 
 		 457 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  53.33 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.96 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.21 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.55 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  50.48 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  50.57 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 492 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.27 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  50.48 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  50.48 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.33 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.12 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  48.86 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  47.77 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.35 
 
 		 490 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  50 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  49.34 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  48.1 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  51.52 
 
 		 488 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  49.34 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.29 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  47.32 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 453 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  50 
 
 		 485 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  49 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  48.97 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  48.87 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.77 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  48.31 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>