More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0318 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  100 
 
 
470 aa  953  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  67.32 
 
 
457 aa  646  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  73.71 
 
 
408 aa  619  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  62.11 
 
 
453 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  61.59 
 
 
454 aa  583  1e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  58.95 
 
 
458 aa  572  1e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  58.48 
 
 
458 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
458 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  60.79 
 
 
484 aa  561  1e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  59.65 
 
 
457 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  58.64 
 
 
459 aa  558  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  63.24 
 
 
415 aa  531  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  55.7 
 
 
457 aa  525  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  56.14 
 
 
454 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  56.14 
 
 
454 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 
453 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 
448 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  52.99 
 
 
453 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  51.11 
 
 
460 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  53.1 
 
 
450 aa  468  1e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  51.78 
 
 
449 aa  469  1e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 
457 aa  469  1e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
454 aa  469  1e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  52.42 
 
 
449 aa  468  1e-130  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50 
 
 
451 aa  466  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  50.88 
 
 
450 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  52.94 
 
 
449 aa  460  1e-128  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  52.5 
 
 
461 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  52.88 
 
 
462 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 
452 aa  454  1e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  49.02 
 
 
452 aa  452  1e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  51.77 
 
 
448 aa  453  1e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 
455 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 
457 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  49.59 
 
 
514 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  49.59 
 
 
514 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  52.65 
 
 
462 aa  446  1e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 
489 aa  446  1e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  48.37 
 
 
465 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  51.43 
 
 
446 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
462 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
462 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  50.43 
 
 
507 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  48.47 
 
 
520 aa  441  1e-122  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 
458 aa  440  1e-122  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 
518 aa  441  1e-122  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
464 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  52.65 
 
 
462 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 
451 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 
452 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 
517 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  50 
 
 
453 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  48.78 
 
 
453 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 
477 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  50 
 
 
453 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 
455 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  45.79 
 
 
461 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  47.59 
 
 
457 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 
456 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  52.64 
 
 
471 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
453 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  47.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 
456 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 
456 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.592741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.67 
 
 
455 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 
455 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 
448 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 
453 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 
476 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 
453 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 
494 aa  422  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 
460 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 
457 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 
453 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 
466 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.55 
 
 
445 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 
453 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 
478 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 
454 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  47.4 
 
 
460 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  48.87 
 
 
467 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>