55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0212 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  830  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  5.17482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  46.43 
 
 
656 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  46.43 
 
 
656 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  48.44 
 
 
652 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  46.43 
 
 
651 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  46.43 
 
 
651 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  46.43 
 
 
651 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  46.43 
 
 
651 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  48.29 
 
 
659 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  46.17 
 
 
651 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  45.92 
 
 
667 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  45.92 
 
 
659 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  46.32 
 
 
640 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  44.25 
 
 
646 aa  345  8e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.70924e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  42.65 
 
 
742 aa  318  8e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  46.15 
 
 
640 aa  274  2e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  42.14 
 
 
640 aa  273  5e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  35.31 
 
 
648 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  34.99 
 
 
647 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  37.69 
 
 
636 aa  263  5e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  43.59 
 
 
648 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  43.17 
 
 
640 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  38.46 
 
 
656 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  34.33 
 
 
679 aa  244  2e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.46 
 
 
620 aa  244  2e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  35.04 
 
 
620 aa  239  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.19693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  35.43 
 
 
647 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  40.18 
 
 
617 aa  233  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  36.18 
 
 
800 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  35.75 
 
 
638 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  36.47 
 
 
666 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  38.89 
 
 
634 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  32.75 
 
 
629 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  32.15 
 
 
634 aa  216  8e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  37.79 
 
 
655 aa  213  5e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  32.58 
 
 
648 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  34.14 
 
 
628 aa  198  1e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  33.93 
 
 
652 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  33.33 
 
 
643 aa  190  3e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  33.61 
 
 
643 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  31.11 
 
 
643 aa  183  5e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  34.49 
 
 
629 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  30.58 
 
 
684 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.36 
 
 
672 aa  179  5e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  30.69 
 
 
673 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  29.78 
 
 
680 aa  175  1e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  31.25 
 
 
686 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  32.65 
 
 
665 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  33.01 
 
 
654 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  31.58 
 
 
633 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  24.14 
 
 
1025 aa  56.2  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  23.62 
 
 
881 aa  50.4  6e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  29.36 
 
 
803 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  20.76 
 
 
765 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.52 
 
 
795 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  2.68125e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>