172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0184 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  100 
 
 
86 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  62.65 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  65.85 
 
 
93 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  60.98 
 
 
91 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.98 
 
 
91 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  57.65 
 
 
93 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.76 
 
 
91 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  59.26 
 
 
89 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  58.23 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.84 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.84 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  57.32 
 
 
87 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.49 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.96 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  53.75 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  54.43 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  50 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  55.7 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  57.69 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  53.09 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  47.67 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  48.81 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.56 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  55.26 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  48.75 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  45.57 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.84 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.68 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  48.78 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  46.84 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  41.77 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.61 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  42.68 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  41.54 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  41.54 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.68 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  39.39 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.97 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  44.9 
 
 
131 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  37.97 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 
141 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  42.86 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.7 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  40.3 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  35.9 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  45.9 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.75 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  35.48 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  37.66 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  38.75 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.75 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  35.94 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  36.07 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.23 
 
 
149 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
132 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 
132 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
132 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  37.04 
 
 
91 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
132 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  40 
 
 
134 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  33.75 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.36 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4117  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.76 
 
 
99 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  39.06 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  35 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  44.23 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  37.18 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  32.5 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  34.94 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  37.25 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  37.25 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  40.62 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0142  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.75 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  35.09 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>