More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0162 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  100 
 
 
371 aa  766  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  51.34 
 
 
370 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  39.04 
 
 
375 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  39.08 
 
 
367 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  37.16 
 
 
367 aa  254  2e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  35.81 
 
 
376 aa  249  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  36.83 
 
 
384 aa  239  6e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  37.53 
 
 
366 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  35.75 
 
 
387 aa  232  8e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  34.55 
 
 
389 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  34.3 
 
 
389 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  34.3 
 
 
389 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  34.55 
 
 
389 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  34.04 
 
 
389 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  34.04 
 
 
389 aa  223  5e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  34.04 
 
 
389 aa  223  5e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.04 
 
 
389 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.04 
 
 
389 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  33.51 
 
 
389 aa  221  1e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  33.77 
 
 
389 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  34.24 
 
 
373 aa  219  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  32.8 
 
 
392 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.58 
 
 
403 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  31.73 
 
 
382 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  31.73 
 
 
382 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.06 
 
 
403 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  31.91 
 
 
378 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  30.65 
 
 
373 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  33.07 
 
 
386 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.81 
 
 
391 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  32.45 
 
 
391 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.18 
 
 
391 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31.91 
 
 
391 aa  191  3e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31.91 
 
 
391 aa  191  3e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  32.18 
 
 
391 aa  190  3e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  30.38 
 
 
382 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.18 
 
 
391 aa  189  6e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.89 
 
 
379 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  31.91 
 
 
391 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  32.63 
 
 
421 aa  189  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.29 
 
 
391 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  31.73 
 
 
373 aa  183  5e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.99 
 
 
403 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  32.02 
 
 
408 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  33.51 
 
 
433 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  33.86 
 
 
384 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  32.29 
 
 
390 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  32.01 
 
 
388 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  33.9 
 
 
364 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.97 
 
 
373 aa  175  1e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  31.2 
 
 
380 aa  174  2e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.71 
 
 
395 aa  174  2e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.7 
 
 
373 aa  174  2e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  32.89 
 
 
851 aa  174  2e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  32.01 
 
 
406 aa  173  4e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.07 
 
 
380 aa  172  6e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  32.29 
 
 
441 aa  172  7e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.88 
 
 
373 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32 
 
 
395 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.6 
 
 
371 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  33.24 
 
 
395 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  31.13 
 
 
398 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  33.06 
 
 
373 aa  166  6e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  31.64 
 
 
389 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  32.28 
 
 
390 aa  163  5e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  30.41 
 
 
364 aa  162  8e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  31.5 
 
 
384 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  31.44 
 
 
369 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  29.87 
 
 
376 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  33.23 
 
 
389 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  31.72 
 
 
380 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  31.12 
 
 
376 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  32.08 
 
 
391 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  32.78 
 
 
386 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  30.97 
 
 
434 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  33.53 
 
 
370 aa  156  5e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  31.55 
 
 
375 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  32.51 
 
 
386 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  33.16 
 
 
399 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  31.37 
 
 
390 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  33.25 
 
 
399 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  29.21 
 
 
379 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  30.29 
 
 
379 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  30.71 
 
 
379 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  30 
 
 
369 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  29.21 
 
 
382 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  31.77 
 
 
399 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  32.63 
 
 
399 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  30.97 
 
 
379 aa  152  6e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  30.77 
 
 
377 aa  153  6e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  31.58 
 
 
380 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  29.97 
 
 
388 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  30.73 
 
 
369 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.00581e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  28.85 
 
 
356 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  29.92 
 
 
373 aa  148  2e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  29.28 
 
 
374 aa  147  2e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  28.61 
 
 
387 aa  148  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  30.58 
 
 
408 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  30.45 
 
 
324 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  27.89 
 
 
398 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>