More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0093 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0093  topoisomerase IA  100 
 
 		 722 aa  1484    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  43.79 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5409  DNA topoisomerase III  43.27 
 
 		 714 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  38.04 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  37.77 
 
 		 714 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  37.77 
 
 		 714 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  37.64 
 
 		 714 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  37.77 
 
 		 714 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  37.77 
 
 		 714 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  38.35 
 
 		 714 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  37.74 
 
 		 714 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  36.55 
 
 		 718 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  35.06 
 
 		 768 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  36.62 
 
 		 680 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  32.78 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  34.91 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 799 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 		 730 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  34.84 
 
 		 744 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 655 aa  351  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  32.44 
 
 		 712 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  31.53 
 
 		 707 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  33.68 
 
 		 673 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  34.38 
 
 		 679 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1310  DNA topoisomerase III  35.54 
 
 		 632 aa  343  8e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00570993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  33.88 
 
 		 679 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  30.83 
 
 		 867 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  34.38 
 
 		 676 aa  342  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  33.98 
 
 		 653 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 707 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  34.04 
 
 		 653 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  33.82 
 
 		 652 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  34.31 
 
 		 654 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 754 aa  337  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  31.9 
 
 		 719 aa  337  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  34.3 
 
 		 670 aa  336  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  33.82 
 
 		 670 aa  336  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1966  DNA topoisomerase III  33.44 
 
 		 640 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  33.82 
 
 		 670 aa  334  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  31.3 
 
 		 675 aa  334  4e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  34.33 
 
 		 722 aa  334  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2208  DNA topoisomerase III  33.01 
 
 		 641 aa  331  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.948709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 676 aa  331  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 676 aa  331  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3275  DNA topoisomerase III  34.71 
 
 		 670 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287374  normal  0.133974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  34.09 
 
 		 731 aa  329  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2478  DNA topoisomerase III  33.93 
 
 		 662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  33.77 
 
 		 650 aa  328  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  32.75 
 
 		 670 aa  328  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  31.66 
 
 		 669 aa  328  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  34.3 
 
 		 721 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2718  DNA topoisomerase III  33.17 
 
 		 641 aa  327  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94815  hitchhiker  0.00169428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2244  DNA topoisomerase III  33.98 
 
 		 656 aa  327  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275193  normal  0.433607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  35.53 
 
 		 689 aa  327  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  32.16 
 
 		 680 aa  326  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  32.47 
 
 		 729 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1630  DNA topoisomerase III  33.65 
 
 		 647 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168302  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  33.9 
 
 		 731 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 729 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 729 aa  324  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 729 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 729 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  31.99 
 
 		 729 aa  324  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  32.85 
 
 		 729 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2088  DNA topoisomerase III  33.44 
 
 		 642 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00112487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  32.37 
 
 		 671 aa  323  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  32.58 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  33.43 
 
 		 671 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03041  DNA topoisomerase III  32.48 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  32.56 
 
 		 729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1979  DNA topoisomerase III  33.44 
 
 		 641 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2343  DNA topoisomerase III  33.44 
 
 		 641 aa  321  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000133374  normal  0.0757376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  32.99 
 
 		 671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  32.21 
 
 		 684 aa  320  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  32.8 
 
 		 655 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  32.7 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3364  DNA topoisomerase III  34.29 
 
 		 647 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  32.47 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1428  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 651 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0037378  normal  0.804884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  31.89 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  33.33 
 
 		 686 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  33.14 
 
 		 730 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01732  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00246982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1879  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  318  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000411002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1847  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  318  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000137821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01720  hypothetical protein  32.01 
 
 		 653 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00317357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1869  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  318  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000214138  decreased coverage  0.00000617518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  32.55 
 
 		 671 aa  318  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 		 729 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1986  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  317  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2483  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000298229  normal  0.566589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2018  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 653 aa  317  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000256516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1425  DNA topoisomerase III  32.17 
 
 		 649 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.864642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1877  DNA topoisomerase III  32.17 
 
 		 649 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000540839  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1392  DNA topoisomerase III  32.17 
 
 		 649 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.213648  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1425  DNA topoisomerase III  32.11 
 
 		 683 aa  316  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.771336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  31.82 
 
 		 670 aa  316  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>