133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0082 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
174 aa  356  8e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 
155 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 
156 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
157 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 
156 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
156 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  51.35 
 
 
152 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  32.77 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.23 
 
 
138 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
148 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
144 aa  52  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
156 aa  52  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  36.76 
 
 
113 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  29.03 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  25.2 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
150 aa  47.8  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
183 aa  47.4  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
149 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 
160 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  27.85 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  31.25 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
152 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
142 aa  44.7  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  22.03 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  26.19 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0360  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>