232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0064 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  100 
 
 
236 aa  472  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  47.06 
 
 
292 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  32.78 
 
 
310 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.81 
 
 
293 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  33.85 
 
 
325 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  30.41 
 
 
337 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  32.47 
 
 
310 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  31 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  31.98 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  31 
 
 
312 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  32.42 
 
 
311 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 
337 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.38 
 
 
505 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  33.52 
 
 
302 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  30.05 
 
 
309 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  32.02 
 
 
304 aa  95.9  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  31.77 
 
 
310 aa  95.9  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  32.63 
 
 
313 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  28.64 
 
 
292 aa  95.1  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  30.26 
 
 
280 aa  95.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29 
 
 
308 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  31.91 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  32.77 
 
 
310 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.29 
 
 
316 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.95 
 
 
298 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  29.83 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  30.88 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  31.69 
 
 
311 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.83 
 
 
279 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.37 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  27.75 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  32.04 
 
 
302 aa  92  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 
324 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.89 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  26.32 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  32.2 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  33.52 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.08 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  32.6 
 
 
313 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  31.49 
 
 
302 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  32.58 
 
 
316 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  30.94 
 
 
285 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  31.49 
 
 
302 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  32.79 
 
 
310 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  30.94 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  32.79 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  27.66 
 
 
286 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  29.35 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  31.95 
 
 
335 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  28.73 
 
 
279 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  29.44 
 
 
281 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  31.79 
 
 
309 aa  85.1  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.55 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  27.89 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  28.89 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.32 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 
312 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.6 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  33.11 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  29.51 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  29.74 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  27.06 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  25.5 
 
 
332 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  27.22 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.33 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  26.8 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  28.99 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  27.65 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  28.85 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  27.59 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  26.87 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  27.33 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  30.38 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  29.21 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  28.24 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  26.32 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  27.62 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  26.32 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  23.56 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  36.46 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  27.55 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  27.53 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  27.27 
 
 
325 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  24.21 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.75 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.7 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  24.88 
 
 
364 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  30 
 
 
342 aa  65.1  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  26.67 
 
 
349 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  30.19 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  29.56 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  30.19 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  26.15 
 
 
349 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  26.16 
 
 
279 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  25.88 
 
 
321 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  28.48 
 
 
355 aa  62  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  23.16 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>