More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0045 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  26.63 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  45.1 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  26.9 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  48 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 243 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 243 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 243 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 248 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 258 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30 
 
 		 400 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2200  putative regulatory protein TetR  25 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.841471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 388 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 276 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.13 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>