13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0043 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0043  ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 
110 aa  223  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0379444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0359  hypothetical protein  29.91 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  28.16 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0933  hypothetical protein  24.77 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  32.61 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1957  hypothetical protein  26.32 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  28.7 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2803  hypothetical protein  20 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.459087  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  25.45 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  25.45 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  25.45 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.510354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>